RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253934.9

TMEM204-201, Transcript of transmembrane protein 204, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM204, Length 1,686 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM204-201ENST00000253934 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.94■■■■■ 5.42
TMEM204-201ENST00000253934 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.99■■■■■ 4.47
TMEM204-201ENST00000253934 ABCC9O60706 1549 aa41.38■■■■■ 4.21
TMEM204-201ENST00000253934 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
TMEM204-201ENST00000253934 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.69■■■■■ 4.1
TMEM204-201ENST00000253934 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.42■■■■■ 4.06
TMEM204-201ENST00000253934 NACADO15069 1562 aa40.21■■■■■ 4.03
TMEM204-201ENST00000253934 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.21■■■■■ 4.03
TMEM204-201ENST00000253934 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.06■■■■■ 4
TMEM204-201ENST00000253934 SCRIBQ14160 1630 aa39.5■■■■□ 3.91
TMEM204-201ENST00000253934 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.47■■■■□ 3.91
TMEM204-201ENST00000253934 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.26■■■■□ 3.88
TMEM204-201ENST00000253934 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.9■■■■□ 3.82
TMEM204-201ENST00000253934 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.88■■■■□ 3.81
TMEM204-201ENST00000253934 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.13■■■■□ 3.69
TMEM204-201ENST00000253934 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
TMEM204-201ENST00000253934 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.81■■■■□ 3.64
TMEM204-201ENST00000253934 SMARCA4P51532 1647 aa37.78■■■■□ 3.64
TMEM204-201ENST00000253934 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
TMEM204-201ENST00000253934 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
TMEM204-201ENST00000253934 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
TMEM204-201ENST00000253934 WIZO95785 1651 aa37.47■■■■□ 3.59
TMEM204-201ENST00000253934 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.41■■■■□ 3.58
TMEM204-201ENST00000253934 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.35■■■■□ 3.57
TMEM204-201ENST00000253934 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.32■■■■□ 3.57
TMEM204-201ENST00000253934 SMARCA2P51531 1590 aa37.27■■■■□ 3.56
TMEM204-201ENST00000253934 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.19■■■■□ 3.54
TMEM204-201ENST00000253934 NCAPD3P42695 1498 aa37.13■■■■□ 3.53
TMEM204-201ENST00000253934 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
TMEM204-201ENST00000253934 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
TMEM204-201ENST00000253934 HMGXB3Q12766 1538 aa37.01■■■■□ 3.52
TMEM204-201ENST00000253934 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.65■■■■□ 3.46
TMEM204-201ENST00000253934 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.13■■■■□ 3.37
TMEM204-201ENST00000253934 NESP48681 1621 aa36.12■■■■□ 3.37
TMEM204-201ENST00000253934 CFTRP13569 1480 aa36.11■■■■□ 3.37
TMEM204-201ENST00000253934 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.99■■■■□ 3.35
TMEM204-201ENST00000253934 PRDM2Q13029 1718 aa35.87■■■■□ 3.33
TMEM204-201ENST00000253934 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.75■■■■□ 3.31
TMEM204-201ENST00000253934 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.72■■■■□ 3.31
TMEM204-201ENST00000253934 ABCC8Q09428 1581 aa35.68■■■■□ 3.3
TMEM204-201ENST00000253934 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.65■■■■□ 3.3
TMEM204-201ENST00000253934 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.58■■■■□ 3.29
TMEM204-201ENST00000253934 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.56■■■■□ 3.28
TMEM204-201ENST00000253934 ERCC6Q03468 1493 aa35.52■■■■□ 3.28
TMEM204-201ENST00000253934 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.49■■■■□ 3.27
TMEM204-201ENST00000253934 SYNJ1O43426 1573 aa35.4■■■■□ 3.26
TMEM204-201ENST00000253934 CUX1P39880 1505 aa35.4■■■■□ 3.26
TMEM204-201ENST00000253934 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
TMEM204-201ENST00000253934 TRIM41Q8WV44 630 aa35.35■■■■□ 3.25
TMEM204-201ENST00000253934 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.33■■■■□ 3.25
TMEM204-201ENST00000253934 TOP2BQ02880 1626 aa35.29■■■■□ 3.24
TMEM204-201ENST00000253934 TOPBP1Q92547 1522 aa35.28■■■■□ 3.24
TMEM204-201ENST00000253934 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.28■■■■□ 3.24
TMEM204-201ENST00000253934 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.26■■■■□ 3.24
TMEM204-201ENST00000253934 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
TMEM204-201ENST00000253934 WDR62O43379 1518 aa35.17■■■■□ 3.22
TMEM204-201ENST00000253934 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.12■■■■□ 3.21
TMEM204-201ENST00000253934 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
TMEM204-201ENST00000253934 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.97■■■■□ 3.19
TMEM204-201ENST00000253934 CUX2O14529 1486 aa34.93■■■■□ 3.18
TMEM204-201ENST00000253934 SOGA1O94964 1423 aa34.92■■■■□ 3.18
TMEM204-201ENST00000253934 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
TMEM204-201ENST00000253934 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.78■■■■□ 3.16
TMEM204-201ENST00000253934 IFT140Q96RY7 1462 aa34.77■■■■□ 3.16
TMEM204-201ENST00000253934 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.77■■■■□ 3.16
TMEM204-201ENST00000253934 WDR97A6NE52 1622 aa34.75■■■■□ 3.15
TMEM204-201ENST00000253934 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
TMEM204-201ENST00000253934 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
TMEM204-201ENST00000253934 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
TMEM204-201ENST00000253934 KIF27Q86VH2 1401 aa34.64■■■■□ 3.14
TMEM204-201ENST00000253934 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.58■■■■□ 3.13
TMEM204-201ENST00000253934 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.56■■■■□ 3.12
TMEM204-201ENST00000253934 EEA1Q15075 1411 aa34.53■■■■□ 3.12
TMEM204-201ENST00000253934 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.52■■■■□ 3.12
TMEM204-201ENST00000253934 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.11
TMEM204-201ENST00000253934 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.47■■■■□ 3.11
TMEM204-201ENST00000253934 IGF1RP08069 1367 aa34.43■■■■□ 3.1
TMEM204-201ENST00000253934 PBRM1Q86U86 1689 aa34.4■■■■□ 3.1
TMEM204-201ENST00000253934 GRIN2BQ13224 1484 aa34.35■■■■□ 3.09
TMEM204-201ENST00000253934 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.34■■■■□ 3.09
TMEM204-201ENST00000253934 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.31■■■■□ 3.08
TMEM204-201ENST00000253934 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.25■■■■□ 3.07
TMEM204-201ENST00000253934 PRXQ9BXM0 1461 aa34.23■■■■□ 3.07
TMEM204-201ENST00000253934 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.23■■■■□ 3.07
TMEM204-201ENST00000253934 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.21■■■■□ 3.07
TMEM204-201ENST00000253934 CUL7Q14999 1698 aa34.2■■■■□ 3.07
TMEM204-201ENST00000253934 ADAMTS12P58397 1594 aa34.17■■■■□ 3.06
TMEM204-201ENST00000253934 KIF21BO75037 1637 aa34.17■■■■□ 3.06
TMEM204-201ENST00000253934 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.16■■■■□ 3.06
TMEM204-201ENST00000253934 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
TMEM204-201ENST00000253934 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.12■■■■□ 3.05
TMEM204-201ENST00000253934 GOLGA3Q08378 1498 aa34.06■■■■□ 3.04
TMEM204-201ENST00000253934 SYNJ2O15056 1496 aa34.02■■■■□ 3.04
TMEM204-201ENST00000253934 FBLN2P98095 1184 aa34.02■■■■□ 3.04
TMEM204-201ENST00000253934 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
TMEM204-201ENST00000253934 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
TMEM204-201ENST00000253934 GRIN2AQ12879 1464 aa33.95■■■■□ 3.03
TMEM204-201ENST00000253934 CHD1O14646 1710 aa33.9■■■■□ 3.02
TMEM204-201ENST00000253934 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.8■■■■□ 3
TMEM204-201ENST00000253934 CEP170Q5SW79 1584 aa33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms