Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSMB9P28065 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSMB9P28065 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSMB9P28065 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSMB9P28065 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSMB9P28065 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMB9P28065 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMB9P28065 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSMB9P28065 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSMB9P28065 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSMB9P28065 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSMB9P28065 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMB9P28065 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMB9P28065 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMB9P28065 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PSMB9P28065 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSMB9P28065 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMB9P28065 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMB9P28065 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMB9P28065 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMB9P28065 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMB9P28065 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMB9P28065 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMB9P28065 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMB9P28065 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMB9P28065 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMB9P28065 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMB9P28065 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMB9P28065 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMB9P28065 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMB9P28065 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMB9P28065 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMB9P28065 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMB9P28065 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMB9P28065 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMB9P28065 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMB9P28065 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMB9P28065 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PSMB9P28065 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMB9P28065 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMB9P28065 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMB9P28065 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMB9P28065 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMB9P28065 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMB9P28065 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMB9P28065 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMB9P28065 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMB9P28065 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMB9P28065 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMB9P28065 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMB9P28065 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMB9P28065 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMB9P28065 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMB9P28065 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMB9P28065 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMB9P28065 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSMB9P28065 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMB9P28065 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMB9P28065 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMB9P28065 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMB9P28065 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMB9P28065 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMB9P28065 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMB9P28065 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PSMB9P28065 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMB9P28065 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMB9P28065 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMB9P28065 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMB9P28065 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMB9P28065 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMB9P28065 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMB9P28065 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMB9P28065 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMB9P28065 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMB9P28065 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMB9P28065 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMB9P28065 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMB9P28065 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMB9P28065 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMB9P28065 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMB9P28065 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMB9P28065 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMB9P28065 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PSMB9P28065 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PSMB9P28065 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PSMB9P28065 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMB9P28065 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMB9P28065 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMB9P28065 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMB9P28065 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMB9P28065 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMB9P28065 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMB9P28065 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMB9P28065 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSMB9P28065 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMB9P28065 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMB9P28065 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMB9P28065 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMB9P28065 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PSMB9P28065 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms