Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms