RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.25■■■■■ 5.32
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.1■■■■■ 4.49
NPAS1-201ENST00000439365 ABCC9O60706 1549 aa42.92■■■■■ 4.46
NPAS1-201ENST00000439365 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.94■■■■■ 4.14
NPAS1-201ENST00000439365 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.84■■■■■ 4.13
NPAS1-201ENST00000439365 NACADO15069 1562 aa40.71■■■■■ 4.11
NPAS1-201ENST00000439365 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.19■■■■■ 4.02
NPAS1-201ENST00000439365 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.07■■■■■ 4
NPAS1-201ENST00000439365 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
NPAS1-201ENST00000439365 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.92■■■■□ 3.98
NPAS1-201ENST00000439365 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.91■■■■□ 3.98
NPAS1-201ENST00000439365 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.82■■■■□ 3.96
NPAS1-201ENST00000439365 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.66■■■■□ 3.94
NPAS1-201ENST00000439365 SCRIBQ14160 1630 aa39.41■■■■□ 3.9
NPAS1-201ENST00000439365 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.16■■■■□ 3.86
NPAS1-201ENST00000439365 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.72■■■■□ 3.79
NPAS1-201ENST00000439365 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
NPAS1-201ENST00000439365 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.6■■■■□ 3.77
NPAS1-201ENST00000439365 NCAPD3P42695 1498 aa37.58■■■■□ 3.61
NPAS1-201ENST00000439365 SMARCA4P51532 1647 aa37.57■■■■□ 3.6
NPAS1-201ENST00000439365 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.54■■■■□ 3.6
NPAS1-201ENST00000439365 SMARCA2P51531 1590 aa37.45■■■■□ 3.59
NPAS1-201ENST00000439365 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
NPAS1-201ENST00000439365 HMGXB3Q12766 1538 aa37.32■■■■□ 3.57
NPAS1-201ENST00000439365 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
NPAS1-201ENST00000439365 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.2■■■■□ 3.55
NPAS1-201ENST00000439365 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.14■■■■□ 3.54
NPAS1-201ENST00000439365 ERCC6Q03468 1493 aa37.08■■■■□ 3.53
NPAS1-201ENST00000439365 NESP48681 1621 aa36.94■■■■□ 3.5
NPAS1-201ENST00000439365 CUX2O14529 1486 aa36.78■■■■□ 3.48
NPAS1-201ENST00000439365 WIZO95785 1651 aa36.78■■■■□ 3.48
NPAS1-201ENST00000439365 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.68■■■■□ 3.46
NPAS1-201ENST00000439365 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
NPAS1-201ENST00000439365 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.53■■■■□ 3.44
NPAS1-201ENST00000439365 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.5■■■■□ 3.43
NPAS1-201ENST00000439365 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.43■■■■□ 3.42
NPAS1-201ENST00000439365 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
NPAS1-201ENST00000439365 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.41■■■■□ 3.42
NPAS1-201ENST00000439365 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.41
NPAS1-201ENST00000439365 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.17■■■■□ 3.38
NPAS1-201ENST00000439365 CFTRP13569 1480 aa36.12■■■■□ 3.37
NPAS1-201ENST00000439365 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.12■■■■□ 3.37
NPAS1-201ENST00000439365 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.1■■■■□ 3.37
NPAS1-201ENST00000439365 WDR62O43379 1518 aa36.02■■■■□ 3.36
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.94■■■■□ 3.34
NPAS1-201ENST00000439365 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
NPAS1-201ENST00000439365 PRDM2Q13029 1718 aa35.72■■■■□ 3.31
NPAS1-201ENST00000439365 TOPBP1Q92547 1522 aa35.43■■■■□ 3.26
NPAS1-201ENST00000439365 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
NPAS1-201ENST00000439365 ABCC8Q09428 1581 aa35.37■■■■□ 3.25
NPAS1-201ENST00000439365 IFT140Q96RY7 1462 aa35.36■■■■□ 3.25
NPAS1-201ENST00000439365 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.32■■■■□ 3.24
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
NPAS1-201ENST00000439365 OSCARQ8IYS5 282 aa35.26■■■■□ 3.23
NPAS1-201ENST00000439365 TRIM41Q8WV44 630 aa35.11■■■■□ 3.21
NPAS1-201ENST00000439365 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
NPAS1-201ENST00000439365 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
NPAS1-201ENST00000439365 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
NPAS1-201ENST00000439365 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.03■■■■□ 3.2
NPAS1-201ENST00000439365 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.99■■■■□ 3.19
NPAS1-201ENST00000439365 SOGA1O94964 1423 aa34.99■■■■□ 3.19
NPAS1-201ENST00000439365 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.94■■■■□ 3.18
NPAS1-201ENST00000439365 CUX1P39880 1505 aa34.93■■■■□ 3.18
NPAS1-201ENST00000439365 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
NPAS1-201ENST00000439365 FBLN2P98095 1184 aa34.86■■■■□ 3.17
NPAS1-201ENST00000439365 CHD1O14646 1710 aa34.73■■■■□ 3.15
NPAS1-201ENST00000439365 WDR97A6NE52 1622 aa34.69■■■■□ 3.14
NPAS1-201ENST00000439365 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.68■■■■□ 3.14
NPAS1-201ENST00000439365 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.68■■■■□ 3.14
NPAS1-201ENST00000439365 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.68■■■■□ 3.14
NPAS1-201ENST00000439365 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.67■■■■□ 3.14
NPAS1-201ENST00000439365 GRIN2BQ13224 1484 aa34.62■■■■□ 3.13
NPAS1-201ENST00000439365 ARHGEF11O15085 1522 aa34.62■■■■□ 3.13
NPAS1-201ENST00000439365 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
NPAS1-201ENST00000439365 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
NPAS1-201ENST00000439365 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.55■■■■□ 3.12
NPAS1-201ENST00000439365 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.53■■■■□ 3.12
NPAS1-201ENST00000439365 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.52■■■■□ 3.12
NPAS1-201ENST00000439365 PBRM1Q86U86 1689 aa34.46■■■■□ 3.11
NPAS1-201ENST00000439365 SYNJ2O15056 1496 aa34.45■■■■□ 3.11
NPAS1-201ENST00000439365 TOP2BQ02880 1626 aa34.45■■■■□ 3.11
NPAS1-201ENST00000439365 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.45■■■■□ 3.11
NPAS1-201ENST00000439365 SYNJ1O43426 1573 aa34.43■■■■□ 3.1
NPAS1-201ENST00000439365 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.42■■■■□ 3.1
NPAS1-201ENST00000439365 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.41■■■■□ 3.1
NPAS1-201ENST00000439365 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.32■■■■□ 3.08
NPAS1-201ENST00000439365 ARAP1Q96P48 1450 aa34.29■■■■□ 3.08
NPAS1-201ENST00000439365 GRIN2AQ12879 1464 aa34.16■■■■□ 3.06
NPAS1-201ENST00000439365 ADAMTS12P58397 1594 aa34.16■■■■□ 3.06
NPAS1-201ENST00000439365 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.11■■■■□ 3.05
NPAS1-201ENST00000439365 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.1■■■■□ 3.05
NPAS1-201ENST00000439365 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
NPAS1-201ENST00000439365 CEP170Q5SW79 1584 aa34■■■■□ 3.03
NPAS1-201ENST00000439365 NUP160Q12769 1436 aa34■■■■□ 3.03
NPAS1-201ENST00000439365 KIF27Q86VH2 1401 aa33.86■■■■□ 3.01
NPAS1-201ENST00000439365 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.85■■■■□ 3.01
NPAS1-201ENST00000439365 IGF1RP08069 1367 aa33.78■■■■□ 3
NPAS1-201ENST00000439365 SHROOM2Q13796 1616 aa33.76■■■■□ 3
NPAS1-201ENST00000439365 JPH4Q96JJ6 628 aa33.75■■■□□ 2.99
NPAS1-201ENST00000439365 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
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