RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587465.6

TNNT1-208, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNNT1, Length 1,065 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-208ENST00000587465 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.63■■■■■ 5.38
TNNT1-208ENST00000587465 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.51■■■■■ 4.56
TNNT1-208ENST00000587465 ABCC9O60706 1549 aa43.42■■■■■ 4.54
TNNT1-208ENST00000587465 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.28■■■■■ 4.2
TNNT1-208ENST00000587465 NACADO15069 1562 aa41.03■■■■■ 4.16
TNNT1-208ENST00000587465 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.94■■■■■ 4.14
TNNT1-208ENST00000587465 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.59■■■■■ 4.09
TNNT1-208ENST00000587465 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.59■■■■■ 4.09
TNNT1-208ENST00000587465 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.47■■■■■ 4.07
TNNT1-208ENST00000587465 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.46■■■■■ 4.07
TNNT1-208ENST00000587465 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
TNNT1-208ENST00000587465 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.24■■■■■ 4.03
TNNT1-208ENST00000587465 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.08■■■■■ 4.01
TNNT1-208ENST00000587465 SCRIBQ14160 1630 aa39.81■■■■□ 3.96
TNNT1-208ENST00000587465 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.43■■■■□ 3.9
TNNT1-208ENST00000587465 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.22■■■■□ 3.87
TNNT1-208ENST00000587465 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
TNNT1-208ENST00000587465 CECR2Q9BXF3 1484 aa39■■■■□ 3.83
TNNT1-208ENST00000587465 SMARCA4P51532 1647 aa37.94■■■■□ 3.66
TNNT1-208ENST00000587465 NCAPD3P42695 1498 aa37.89■■■■□ 3.66
TNNT1-208ENST00000587465 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.88■■■■□ 3.65
TNNT1-208ENST00000587465 SMARCA2P51531 1590 aa37.71■■■■□ 3.63
TNNT1-208ENST00000587465 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
TNNT1-208ENST00000587465 HMGXB3Q12766 1538 aa37.66■■■■□ 3.62
TNNT1-208ENST00000587465 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.58■■■■□ 3.61
TNNT1-208ENST00000587465 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
TNNT1-208ENST00000587465 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.5■■■■□ 3.59
TNNT1-208ENST00000587465 NESP48681 1621 aa37.42■■■■□ 3.58
TNNT1-208ENST00000587465 ERCC6Q03468 1493 aa37.35■■■■□ 3.57
TNNT1-208ENST00000587465 WIZO95785 1651 aa37.18■■■■□ 3.54
TNNT1-208ENST00000587465 CUX2O14529 1486 aa37.15■■■■□ 3.54
TNNT1-208ENST00000587465 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37■■■■□ 3.51
TNNT1-208ENST00000587465 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
TNNT1-208ENST00000587465 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.95■■■■□ 3.51
TNNT1-208ENST00000587465 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.9■■■■□ 3.5
TNNT1-208ENST00000587465 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
TNNT1-208ENST00000587465 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.75■■■■□ 3.47
TNNT1-208ENST00000587465 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.71■■■■□ 3.47
TNNT1-208ENST00000587465 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
TNNT1-208ENST00000587465 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.49■■■■□ 3.43
TNNT1-208ENST00000587465 WDR62O43379 1518 aa36.43■■■■□ 3.42
TNNT1-208ENST00000587465 CFTRP13569 1480 aa36.41■■■■□ 3.42
TNNT1-208ENST00000587465 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.39■■■■□ 3.42
TNNT1-208ENST00000587465 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.38■■■■□ 3.41
TNNT1-208ENST00000587465 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.21■■■■□ 3.39
TNNT1-208ENST00000587465 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
TNNT1-208ENST00000587465 PRDM2Q13029 1718 aa36.15■■■■□ 3.38
TNNT1-208ENST00000587465 TOPBP1Q92547 1522 aa35.76■■■■□ 3.31
TNNT1-208ENST00000587465 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
TNNT1-208ENST00000587465 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.62■■■■□ 3.29
TNNT1-208ENST00000587465 IFT140Q96RY7 1462 aa35.61■■■■□ 3.29
TNNT1-208ENST00000587465 ABCC8Q09428 1581 aa35.5■■■■□ 3.27
TNNT1-208ENST00000587465 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
TNNT1-208ENST00000587465 TRIM41Q8WV44 630 aa35.47■■■■□ 3.27
TNNT1-208ENST00000587465 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
TNNT1-208ENST00000587465 OSCARQ8IYS5 282 aa35.45■■■■□ 3.27
TNNT1-208ENST00000587465 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
TNNT1-208ENST00000587465 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
TNNT1-208ENST00000587465 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.35■■■■□ 3.257e-7■■■■□ 24.2
TNNT1-208ENST00000587465 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.35■■■■□ 3.25
TNNT1-208ENST00000587465 CUX1P39880 1505 aa35.28■■■■□ 3.24
TNNT1-208ENST00000587465 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.23■■■■□ 3.23
TNNT1-208ENST00000587465 CHD1O14646 1710 aa35.23■■■■□ 3.23
TNNT1-208ENST00000587465 SOGA1O94964 1423 aa35.18■■■■□ 3.22
TNNT1-208ENST00000587465 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.17■■■■□ 3.22
TNNT1-208ENST00000587465 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.17■■■■□ 3.22
TNNT1-208ENST00000587465 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.17■■■■□ 3.22
TNNT1-208ENST00000587465 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
TNNT1-208ENST00000587465 ARHGEF11O15085 1522 aa35.05■■■■□ 3.2
TNNT1-208ENST00000587465 WDR97A6NE52 1622 aa35.03■■■■□ 3.2
TNNT1-208ENST00000587465 FBLN2P98095 1184 aa35■■■■□ 3.19
TNNT1-208ENST00000587465 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.99■■■■□ 3.19
TNNT1-208ENST00000587465 PBRM1Q86U86 1689 aa34.86■■■■□ 3.17
TNNT1-208ENST00000587465 GRIN2BQ13224 1484 aa34.84■■■■□ 3.17
TNNT1-208ENST00000587465 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
TNNT1-208ENST00000587465 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.8■■■■□ 3.16
TNNT1-208ENST00000587465 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.78■■■■□ 3.16
TNNT1-208ENST00000587465 SYNJ1O43426 1573 aa34.78■■■■□ 3.16
TNNT1-208ENST00000587465 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.78■■■■□ 3.16
TNNT1-208ENST00000587465 ARAP1Q96P48 1450 aa34.76■■■■□ 3.15
TNNT1-208ENST00000587465 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.76■■■■□ 3.15
TNNT1-208ENST00000587465 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.73■■■■□ 3.15
TNNT1-208ENST00000587465 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.72■■■■□ 3.15
TNNT1-208ENST00000587465 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
TNNT1-208ENST00000587465 SYNJ2O15056 1496 aa34.71■■■■□ 3.15
TNNT1-208ENST00000587465 TOP2BQ02880 1626 aa34.7■■■■□ 3.15
TNNT1-208ENST00000587465 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.68■■■■□ 3.14
TNNT1-208ENST00000587465 ADAMTS12P58397 1594 aa34.52■■■■□ 3.12
TNNT1-208ENST00000587465 GRIN2AQ12879 1464 aa34.45■■■■□ 3.1
TNNT1-208ENST00000587465 CEP170Q5SW79 1584 aa34.4■■■■□ 3.1
TNNT1-208ENST00000587465 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.36■■■■□ 3.09
TNNT1-208ENST00000587465 NUP160Q12769 1436 aa34.31■■■■□ 3.08
TNNT1-208ENST00000587465 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.31■■■■□ 3.08
TNNT1-208ENST00000587465 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.3■■■■□ 3.08
TNNT1-208ENST00000587465 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
TNNT1-208ENST00000587465 SHROOM2Q13796 1616 aa34.18■■■■□ 3.06
TNNT1-208ENST00000587465 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.03■■■■□ 3.04
TNNT1-208ENST00000587465 IGF1RP08069 1367 aa33.98■■■■□ 3.03
TNNT1-208ENST00000587465 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
TNNT1-208ENST00000587465 KIF27Q86VH2 1401 aa33.95■■■■□ 3.02
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