RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.05■■■■■ 5.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.77■■■■■ 4.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ABCC9O60706 1549 aa42.1■■■■■ 4.33
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.41■■■■■ 4.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.4■■■■■ 4.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NACADO15069 1562 aa40.3■■■■■ 4.04
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.96■■■■□ 3.99
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.73■■■■□ 3.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.33■■■■□ 3.89
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.33■■■■□ 3.89
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.08■■■■□ 3.85
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCRIBQ14160 1630 aa39.07■■■■□ 3.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.02■■■■□ 3.84
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.76■■■■□ 3.8
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.02■■■■□ 3.68
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.85■■■■□ 3.65
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMARCA4P51532 1647 aa37.31■■■■□ 3.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NCAPD3P42695 1498 aa37.18■■■■□ 3.54
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.17■■■■□ 3.54
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMARCA2P51531 1590 aa37.16■■■■□ 3.54
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MROH2BQ7Z745 1585 aa37■■■■□ 3.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HMGXB3Q12766 1538 aa36.98■■■■□ 3.51
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.91■■■■□ 3.5
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WIZO95785 1651 aa36.59■■■■□ 3.45
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERCC6Q03468 1493 aa36.38■■■■□ 3.41
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NESP48681 1621 aa36.32■■■■□ 3.4
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.23■■■■□ 3.39
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.08■■■■□ 3.37
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CUX2O14529 1486 aa35.99■■■■□ 3.35
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.85■■■■□ 3.33
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CFTRP13569 1480 aa35.84■■■■□ 3.33
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.82■■■■□ 3.32
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.81■■■■□ 3.32
HOXB-AS3-204ENST00000466037 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.71■■■■□ 3.31
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.7■■■■□ 3.31
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.67■■■■□ 3.3
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WDR62O43379 1518 aa35.51■■■■□ 3.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRDM2Q13029 1718 aa35.48■■■■□ 3.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ABCC8Q09428 1581 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TOPBP1Q92547 1522 aa35.09■■■■□ 3.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.04■■■■□ 3.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IFT140Q96RY7 1462 aa34.96■■■■□ 3.19
HOXB-AS3-204ENST00000466037 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CUX1P39880 1505 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SOGA1O94964 1423 aa34.69■■■■□ 3.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.69■■■■□ 3.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.64■■■■□ 3.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.58■■■■□ 3.13
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OSCARQ8IYS5 282 aa34.52■■■■□ 3.12
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.52■■■■□ 3.12
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIM41Q8WV44 630 aa34.5■■■■□ 3.11
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WDR97A6NE52 1622 aa34.44■■■■□ 3.1
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TOP2BQ02880 1626 aa34.41■■■■□ 3.1
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.37■■■■□ 3.09
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SYNJ1O43426 1573 aa34.36■■■■□ 3.09
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.33■■■■□ 3.09
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBLN2P98095 1184 aa34.32■■■■□ 3.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GRIN2BQ13224 1484 aa34.3■■■■□ 3.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.27■■■■□ 3.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.26■■■■□ 3.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CHD1O14646 1710 aa34.18■■■■□ 3.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.17■■■■□ 3.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PBRM1Q86U86 1689 aa34.13■■■■□ 3.05
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SYNJ2O15056 1496 aa34.09■■■■□ 3.05
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.93■■■■□ 3.02
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADAMTS12P58397 1594 aa33.89■■■■□ 3.02
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARHGEF11O15085 1522 aa33.89■■■■□ 3.02
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.87■■■■□ 3.01
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.87■■■■□ 3.01
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.87■■■■□ 3.01
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.87■■■■□ 3.01
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIF27Q86VH2 1401 aa33.84■■■■□ 3.01
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GRIN2AQ12879 1464 aa33.83■■■■□ 3.01
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.82■■■■□ 3
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IGF1RP08069 1367 aa33.67■■■□□ 2.98
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NUP160Q12769 1436 aa33.66■■■□□ 2.98
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.66■■■□□ 2.98
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CEP170Q5SW79 1584 aa33.63■■■□□ 2.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CUL7Q14999 1698 aa33.58■■■□□ 2.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARAP1Q96P48 1450 aa33.58■■■□□ 2.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.5■■■□□ 2.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 JPH4Q96JJ6 628 aa33.39■■■□□ 2.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.38■■■□□ 2.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SHROOM2Q13796 1616 aa33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms