RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345348.9

TM7SF2-202, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF2, Length 1,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF2-202ENST00000345348 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.91■■■■■ 5.26
TM7SF2-202ENST00000345348 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.48■■■■■ 4.39
TM7SF2-202ENST00000345348 ABCC9O60706 1549 aa41.25■■■■■ 4.19
TM7SF2-202ENST00000345348 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
TM7SF2-202ENST00000345348 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.94■■■■□ 3.98
TM7SF2-202ENST00000345348 NACADO15069 1562 aa39.84■■■■□ 3.97
TM7SF2-202ENST00000345348 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.82■■■■□ 3.97
TM7SF2-202ENST00000345348 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.68■■■■□ 3.94
TM7SF2-202ENST00000345348 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.63■■■■□ 3.94
TM7SF2-202ENST00000345348 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39■■■■□ 3.83
TM7SF2-202ENST00000345348 SCRIBQ14160 1630 aa38.79■■■■□ 3.8
TM7SF2-202ENST00000345348 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.61■■■■□ 3.77
TM7SF2-202ENST00000345348 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.6■■■■□ 3.77
TM7SF2-202ENST00000345348 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.19■■■■□ 3.7
TM7SF2-202ENST00000345348 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
TM7SF2-202ENST00000345348 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.56■■■■□ 3.6
TM7SF2-202ENST00000345348 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.34■■■■□ 3.57
TM7SF2-202ENST00000345348 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.29■■■■□ 3.56
TM7SF2-202ENST00000345348 SMARCA4P51532 1647 aa37.13■■■■□ 3.53
TM7SF2-202ENST00000345348 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
TM7SF2-202ENST00000345348 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.93■■■■□ 3.5
TM7SF2-202ENST00000345348 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.82■■■■□ 3.49
TM7SF2-202ENST00000345348 SMARCA2P51531 1590 aa36.81■■■■□ 3.48
TM7SF2-202ENST00000345348 NCAPD3P42695 1498 aa36.74■■■■□ 3.47
TM7SF2-202ENST00000345348 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.74■■■■□ 3.47
TM7SF2-202ENST00000345348 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
TM7SF2-202ENST00000345348 HMGXB3Q12766 1538 aa36.6■■■■□ 3.45
TM7SF2-202ENST00000345348 WIZO95785 1651 aa36.59■■■■□ 3.45
TM7SF2-202ENST00000345348 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
TM7SF2-202ENST00000345348 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
TM7SF2-202ENST00000345348 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
TM7SF2-202ENST00000345348 NESP48681 1621 aa35.8■■■■□ 3.32
TM7SF2-202ENST00000345348 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.75■■■■□ 3.31
TM7SF2-202ENST00000345348 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.75■■■■□ 3.31
TM7SF2-202ENST00000345348 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.69■■■■□ 3.3
TM7SF2-202ENST00000345348 CFTRP13569 1480 aa35.55■■■■□ 3.28
TM7SF2-202ENST00000345348 ERCC6Q03468 1493 aa35.54■■■■□ 3.28
TM7SF2-202ENST00000345348 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.48■■■■□ 3.27
TM7SF2-202ENST00000345348 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.43■■■■□ 3.26
TM7SF2-202ENST00000345348 PRDM2Q13029 1718 aa35.4■■■■□ 3.26
TM7SF2-202ENST00000345348 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.3■■■■□ 3.24
TM7SF2-202ENST00000345348 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.23■■■■□ 3.23
TM7SF2-202ENST00000345348 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
TM7SF2-202ENST00000345348 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.1■■■■□ 3.21
TM7SF2-202ENST00000345348 CUX2O14529 1486 aa35.02■■■■□ 3.2
TM7SF2-202ENST00000345348 WDR62O43379 1518 aa34.98■■■■□ 3.19
TM7SF2-202ENST00000345348 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
TM7SF2-202ENST00000345348 ABCC8Q09428 1581 aa34.79■■■■□ 3.16
TM7SF2-202ENST00000345348 TOPBP1Q92547 1522 aa34.78■■■■□ 3.16
TM7SF2-202ENST00000345348 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.76■■■■□ 3.16
TM7SF2-202ENST00000345348 CUX1P39880 1505 aa34.63■■■■□ 3.13
TM7SF2-202ENST00000345348 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.53■■■■□ 3.125e-6■■■■■ 29.2
TM7SF2-202ENST00000345348 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
TM7SF2-202ENST00000345348 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.47■■■■□ 3.11
TM7SF2-202ENST00000345348 IFT140Q96RY7 1462 aa34.47■■■■□ 3.11
TM7SF2-202ENST00000345348 SYNJ1O43426 1573 aa34.44■■■■□ 3.1
TM7SF2-202ENST00000345348 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.43■■■■□ 3.1
TM7SF2-202ENST00000345348 TOP2BQ02880 1626 aa34.43■■■■□ 3.1
TM7SF2-202ENST00000345348 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
TM7SF2-202ENST00000345348 SOGA1O94964 1423 aa34.36■■■■□ 3.09
TM7SF2-202ENST00000345348 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.35■■■■□ 3.09
TM7SF2-202ENST00000345348 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
TM7SF2-202ENST00000345348 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.06
TM7SF2-202ENST00000345348 WDR97A6NE52 1622 aa34.19■■■■□ 3.06
TM7SF2-202ENST00000345348 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.15■■■■□ 3.068e-6■■■■□ 23.2
TM7SF2-202ENST00000345348 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.13■■■■□ 3.05
TM7SF2-202ENST00000345348 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
TM7SF2-202ENST00000345348 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.99■■■■□ 3.03
TM7SF2-202ENST00000345348 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.98■■■■□ 3.03
TM7SF2-202ENST00000345348 TRIM41Q8WV44 630 aa33.95■■■■□ 3.02
TM7SF2-202ENST00000345348 PBRM1Q86U86 1689 aa33.93■■■■□ 3.02
TM7SF2-202ENST00000345348 GRIN2BQ13224 1484 aa33.92■■■■□ 3.02
TM7SF2-202ENST00000345348 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.84■■■■□ 3.01
TM7SF2-202ENST00000345348 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
TM7SF2-202ENST00000345348 KIF27Q86VH2 1401 aa33.78■■■■□ 3
TM7SF2-202ENST00000345348 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.74■■■□□ 2.99
TM7SF2-202ENST00000345348 CHD1O14646 1710 aa33.74■■■□□ 2.99
TM7SF2-202ENST00000345348 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.72■■■□□ 2.99
TM7SF2-202ENST00000345348 FBLN2P98095 1184 aa33.69■■■□□ 2.98
TM7SF2-202ENST00000345348 SYNJ2O15056 1496 aa33.67■■■□□ 2.98
TM7SF2-202ENST00000345348 ADAMTS12P58397 1594 aa33.64■■■□□ 2.98
TM7SF2-202ENST00000345348 OSCARQ8IYS5 282 aa33.64■■■□□ 2.98
TM7SF2-202ENST00000345348 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
TM7SF2-202ENST00000345348 IGF1RP08069 1367 aa33.58■■■□□ 2.97
TM7SF2-202ENST00000345348 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.58■■■□□ 2.97
TM7SF2-202ENST00000345348 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.58■■■□□ 2.97
TM7SF2-202ENST00000345348 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.57■■■□□ 2.97
TM7SF2-202ENST00000345348 CUL7Q14999 1698 aa33.52■■■□□ 2.96
TM7SF2-202ENST00000345348 GRIN2AQ12879 1464 aa33.49■■■□□ 2.95
TM7SF2-202ENST00000345348 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.41■■■□□ 2.94
TM7SF2-202ENST00000345348 EEA1Q15075 1411 aa33.33■■■□□ 2.93
TM7SF2-202ENST00000345348 CEP170Q5SW79 1584 aa33.32■■■□□ 2.92
TM7SF2-202ENST00000345348 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.32■■■□□ 2.92
TM7SF2-202ENST00000345348 NUP160Q12769 1436 aa33.31■■■□□ 2.92
TM7SF2-202ENST00000345348 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.25■■■□□ 2.91
TM7SF2-202ENST00000345348 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.25■■■□□ 2.91
TM7SF2-202ENST00000345348 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
TM7SF2-202ENST00000345348 PRXQ9BXM0 1461 aa33.2■■■□□ 2.91
TM7SF2-202ENST00000345348 ARHGEF11O15085 1522 aa33.11■■■□□ 2.89
TM7SF2-202ENST00000345348 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms