RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274609.5

ADAMTS2-202, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ADAMTS2, Length 2,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS2-202ENST00000274609 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.72■■■■■ 4.91
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ADAMTS2-202ENST00000274609 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.7■■■■□ 3.62
ADAMTS2-202ENST00000274609 ABCC9O60706 1549 aa37.64■■■■□ 3.62
ADAMTS2-202ENST00000274609 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.64■■■■□ 3.62
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ADAMTS2-202ENST00000274609 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.7■■■■□ 3.31
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ADAMTS2-202ENST00000274609 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.64■■■■□ 3.3
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ADAMTS2-202ENST00000274609 SMARCA4P51532 1647 aa35.08■■■■□ 3.21
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ADAMTS2-202ENST00000274609 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.54■■■■□ 3.12
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ADAMTS2-202ENST00000274609 SMARCA2P51531 1590 aa34.39■■■■□ 3.1
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ADAMTS2-202ENST00000274609 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.46■■■□□ 2.95
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ADAMTS2-202ENST00000274609 CEP162Q5TB80 1403 aa32.6■■■□□ 2.81
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ADAMTS2-202ENST00000274609 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.51■■■□□ 2.79
ADAMTS2-202ENST00000274609 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.5■■■□□ 2.79
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ADAMTS2-202ENST00000274609 ARAP1Q96P48 1450 aa31.84■■■□□ 2.69
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ADAMTS2-202ENST00000274609 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
ADAMTS2-202ENST00000274609 APLP2Q06481 763 aa31.74■■■□□ 2.67
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