Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 APEH-212ENST00000469362 830 ntTSL 310.97□□□□□ -0.658e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.98e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.98e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 KPNB1-211ENST00000582097 2347 ntTSL 28.67□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 SLC3A2-214ENST00000539507 534 ntTSL 36.56□□□□□ -1.367e-7■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 DHX9-201ENST00000367549 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.234e-8■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.274e-8■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.314e-8■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.44e-8■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 NDRG1-224ENST00000522738 530 ntTSL 511.31□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 NDRG1-227ENST00000523892 562 ntTSL 48.72□□□□□ -1.013e-7■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.022e-11■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 PEX13-205ENST00000472678 601 ntTSL 213.11□□□□□ -0.316e-11■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.276e-11■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 JUP-212ENST00000591690 583 ntTSL 318.87■□□□□ 0.614e-10■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 JUP-206ENST00000437187 1029 ntTSL 315.27■□□□□ 0.044e-10■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 JUP-205ENST00000424457 949 ntTSL 315.27■□□□□ 0.044e-10■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 JUP-211ENST00000589036 566 ntTSL 414.31□□□□□ -0.124e-10■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.564e-10■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 JUP-203ENST00000393931 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.634e-10■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 SETD5-207ENST00000415650 579 ntTSL 414.13□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.424e-6■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.474e-6■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 FUS-212ENST00000569760 639 ntTSL 223.51■■□□□ 1.351e-9■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 FUS-204ENST00000483853 778 ntTSL 221■□□□□ 0.951e-9■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 RCC1-210ENST00000434290 1070 ntTSL 513.59□□□□□ -0.232e-18■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 RCC1-207ENST00000427469 903 ntTSL 513.06□□□□□ -0.322e-18■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.592e-18■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.722e-18■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.198e-63■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 VMP1-213ENST00000591877 791 ntTSL 37.42□□□□□ -1.228e-63■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 VMP1-208ENST00000588617 884 ntTSL 45.1□□□□□ -1.598e-63■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 VMP1-215ENST00000592619 838 ntTSL 54.66□□□□□ -1.668e-63■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 VMP1-205ENST00000587470 995 ntTSL 23.62□□□□□ -1.838e-63■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 VMP1-216ENST00000592790 4325 nt3.55□□□□□ -1.848e-63■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 VMP1-212ENST00000591782 729 ntTSL 52.64□□□□□ -1.998e-63■■■■■ 27.1
RBM22Q9NW64 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 WDR90-222ENST00000552683 2342 ntTSL 218.93■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 WDR90-223ENST00000552728 3133 ntTSL 515.24■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 WDR90-204ENST00000546516 3593 ntTSL 213.76□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 WDR90-207ENST00000547407 3847 ntTSL 213.42□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 TALDO1-208ENST00000532685 568 ntTSL 218.23■□□□□ 0.517e-8■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 SAR1A-203ENST00000373239 468 ntTSL 313.94□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 TALDO1-209ENST00000533796 503 ntTSL 211.69□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.892e-9■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 SAR1A-208ENST00000477464 529 ntTSL 23.5□□□□□ -1.853e-6■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 OPLAH-203ENST00000567871 792 ntTSL 518.21■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 PCNA-201ENST00000379143 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 517.49■□□□□ 0.392e-9■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 516.5■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.012e-9■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 515.01□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 59.94□□□□□ -0.822e-9■■■■■ 27
RBM22Q9NW64 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.364e-8■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.454e-8■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 PTK2-218ENST00000519993 4388 ntTSL 1 (best)18.09■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 EEF1A1-204ENST00000356303 635 ntTSL 28.83□□□□□ -15e-17■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.213e-7■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.263e-7■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 PTK2-215ENST00000519654 4129 ntTSL 1 (best)6.06□□□□□ -1.443e-7■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.623e-7■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 58.49□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 TRIR-204ENST00000591254 988 ntTSL 225.6■■□□□ 1.693e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.33e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.233e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.153e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 YBX1-203ENST00000436427 1524 ntTSL 1 (best)21.77■■□□□ 1.083e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.043e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 PSME3-204ENST00000543428 956 ntTSL 221.49■■□□□ 1.033e-7■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 YBX1-202ENST00000332220 776 ntTSL 521.2■□□□□ 0.983e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.833e-7■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 PSME3-209ENST00000589469 733 ntTSL 320.2■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 WDR18-210ENST00000591997 577 ntTSL 320.09■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 WDR18-209ENST00000591985 1498 ntTSL 519■□□□□ 0.633e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 YBX1-204ENST00000467957 770 ntTSL 218.78■□□□□ 0.63e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 IFRD1-209ENST00000445335 570 ntTSL 418.61■□□□□ 0.573e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 ARIH2-227ENST00000490095 1001 ntTSL 518.55■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 ARIH2-230ENST00000495761 569 ntTSL 318.19■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 TRIR-203ENST00000589590 930 ntTSL 217.8■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 ATG13-223ENST00000577256 613 ntTSL 417.75■□□□□ 0.433e-9■■■■■ 26.9
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