RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590720.5

PSME3-210, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 998 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-210ENST00000590720 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.68■■■■■ 5.7
PSME3-210ENST00000590720 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.43■■■■■ 4.86
PSME3-210ENST00000590720 ABCC9O60706 1549 aa45.16■■■■■ 4.82
PSME3-210ENST00000590720 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.11■■■■■ 4.49
PSME3-210ENST00000590720 NACADO15069 1562 aa42.86■■■■■ 4.45
PSME3-210ENST00000590720 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.58■■■■■ 4.41
PSME3-210ENST00000590720 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.36■■■■■ 4.37
PSME3-210ENST00000590720 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.16■■■■■ 4.34
PSME3-210ENST00000590720 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.1■■■■■ 4.33
PSME3-210ENST00000590720 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
PSME3-210ENST00000590720 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.02■■■■■ 4.32
PSME3-210ENST00000590720 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.9■■■■■ 4.3
PSME3-210ENST00000590720 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.84■■■■■ 4.29
PSME3-210ENST00000590720 SCRIBQ14160 1630 aa41.4■■■■■ 4.22
PSME3-210ENST00000590720 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.33■■■■■ 4.21
PSME3-210ENST00000590720 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.82■■■■■ 4.13
PSME3-210ENST00000590720 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
PSME3-210ENST00000590720 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.65■■■■■ 4.1
PSME3-210ENST00000590720 NCAPD3P42695 1498 aa39.55■■■■□ 3.92
PSME3-210ENST00000590720 SMARCA4P51532 1647 aa39.51■■■■□ 3.92
PSME3-210ENST00000590720 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.46■■■■□ 3.91
PSME3-210ENST00000590720 SMARCA2P51531 1590 aa39.38■■■■□ 3.9
PSME3-210ENST00000590720 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
PSME3-210ENST00000590720 HMGXB3Q12766 1538 aa39.32■■■■□ 3.89
PSME3-210ENST00000590720 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.13■■■■□ 3.85
PSME3-210ENST00000590720 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
PSME3-210ENST00000590720 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.06■■■■□ 3.84
PSME3-210ENST00000590720 ERCC6Q03468 1493 aa38.98■■■■□ 3.83
PSME3-210ENST00000590720 NESP48681 1621 aa38.86■■■■□ 3.81
PSME3-210ENST00000590720 CUX2O14529 1486 aa38.85■■■■□ 3.81
PSME3-210ENST00000590720 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.65■■■■□ 3.78
PSME3-210ENST00000590720 WIZO95785 1651 aa38.62■■■■□ 3.77
PSME3-210ENST00000590720 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.49■■■■□ 3.75
PSME3-210ENST00000590720 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
PSME3-210ENST00000590720 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.41■■■■□ 3.74
PSME3-210ENST00000590720 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.38■■■■□ 3.73
PSME3-210ENST00000590720 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.34■■■■□ 3.73
PSME3-210ENST00000590720 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
PSME3-210ENST00000590720 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.16■■■■□ 3.7
PSME3-210ENST00000590720 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.06■■■■□ 3.68
PSME3-210ENST00000590720 WDR62O43379 1518 aa37.98■■■■□ 3.67
PSME3-210ENST00000590720 CFTRP13569 1480 aa37.97■■■■□ 3.67
PSME3-210ENST00000590720 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.96■■■■□ 3.67
PSME3-210ENST00000590720 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.93■■■■□ 3.66
PSME3-210ENST00000590720 PRDM2Q13029 1718 aa37.68■■■■□ 3.62
PSME3-210ENST00000590720 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.68■■■■□ 3.62
PSME3-210ENST00000590720 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
PSME3-210ENST00000590720 TOPBP1Q92547 1522 aa37.25■■■■□ 3.55
PSME3-210ENST00000590720 IFT140Q96RY7 1462 aa37.19■■■■□ 3.54
PSME3-210ENST00000590720 ABCC8Q09428 1581 aa37.16■■■■□ 3.54
PSME3-210ENST00000590720 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.15■■■■□ 3.54
PSME3-210ENST00000590720 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
PSME3-210ENST00000590720 OSCARQ8IYS5 282 aa37.03■■■■□ 3.52
PSME3-210ENST00000590720 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
PSME3-210ENST00000590720 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
PSME3-210ENST00000590720 TRIM41Q8WV44 630 aa36.9■■■■□ 3.5
PSME3-210ENST00000590720 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.5
PSME3-210ENST00000590720 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.77■■■■□ 3.484e-7■■■■□ 21.8
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PSME3-210ENST00000590720 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.72■■■■□ 3.47
PSME3-210ENST00000590720 CUX1P39880 1505 aa36.69■■■■□ 3.46
PSME3-210ENST00000590720 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.69■■■■□ 3.46
PSME3-210ENST00000590720 SOGA1O94964 1423 aa36.68■■■■□ 3.46
PSME3-210ENST00000590720 CHD1O14646 1710 aa36.63■■■■□ 3.45
PSME3-210ENST00000590720 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.62■■■■□ 3.45
PSME3-210ENST00000590720 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.62■■■■□ 3.45
PSME3-210ENST00000590720 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.62■■■■□ 3.45
PSME3-210ENST00000590720 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.45
PSME3-210ENST00000590720 WDR97A6NE52 1622 aa36.57■■■■□ 3.44
PSME3-210ENST00000590720 ARHGEF11O15085 1522 aa36.52■■■■□ 3.44
PSME3-210ENST00000590720 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.44■■■■□ 3.42
PSME3-210ENST00000590720 FBLN2P98095 1184 aa36.44■■■■□ 3.42
PSME3-210ENST00000590720 GRIN2BQ13224 1484 aa36.36■■■■□ 3.41
PSME3-210ENST00000590720 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
PSME3-210ENST00000590720 PBRM1Q86U86 1689 aa36.29■■■■□ 3.4
PSME3-210ENST00000590720 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.29■■■■□ 3.4
PSME3-210ENST00000590720 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.25■■■■□ 3.39
PSME3-210ENST00000590720 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.24■■■■□ 3.39
PSME3-210ENST00000590720 SYNJ2O15056 1496 aa36.23■■■■□ 3.39
PSME3-210ENST00000590720 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
PSME3-210ENST00000590720 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.21■■■■□ 3.39
PSME3-210ENST00000590720 SYNJ1O43426 1573 aa36.2■■■■□ 3.39
PSME3-210ENST00000590720 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.19■■■■□ 3.38
PSME3-210ENST00000590720 TOP2BQ02880 1626 aa36.18■■■■□ 3.38
PSME3-210ENST00000590720 ARAP1Q96P48 1450 aa36.18■■■■□ 3.38
PSME3-210ENST00000590720 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.15■■■■□ 3.38
PSME3-210ENST00000590720 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.15■■■■□ 3.38
PSME3-210ENST00000590720 ADAMTS12P58397 1594 aa35.95■■■■□ 3.35
PSME3-210ENST00000590720 GRIN2AQ12879 1464 aa35.91■■■■□ 3.34
PSME3-210ENST00000590720 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.83■■■■□ 3.33
PSME3-210ENST00000590720 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.81■■■■□ 3.32
PSME3-210ENST00000590720 CEP170Q5SW79 1584 aa35.79■■■■□ 3.32
PSME3-210ENST00000590720 NUP160Q12769 1436 aa35.77■■■■□ 3.32
PSME3-210ENST00000590720 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
PSME3-210ENST00000590720 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.65■■■■□ 3.3
PSME3-210ENST00000590720 SHROOM2Q13796 1616 aa35.62■■■■□ 3.29
PSME3-210ENST00000590720 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.45■■■■□ 3.27
PSME3-210ENST00000590720 KIF27Q86VH2 1401 aa35.43■■■■□ 3.26
PSME3-210ENST00000590720 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
PSME3-210ENST00000590720 CUL7Q14999 1698 aa35.38■■■■□ 3.25
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