Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 KHDRBS1-203ENST00000484270 1989 ntTSL 520.65■□□□□ 0.95e-8■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 KHDRBS1-201ENST00000307714 2738 ntTSL 1 (best)19.6■□□□□ 0.735e-8■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.065e-8■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 THOC2-209ENST00000448128 1365 ntTSL 57.28□□□□□ -1.244e-15■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 THOC2-219ENST00000497887 768 ntTSL 37.23□□□□□ -1.254e-15■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 THOC2-217ENST00000492203 641 ntTSL 36.61□□□□□ -1.354e-15■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 THOC2-208ENST00000441692 4364 ntTSL 54.03□□□□□ -1.764e-15■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.854e-15■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.782e-11■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 18e-9■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.153e-8■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.013e-8■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 KIF18B-202ENST00000587309 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.753e-8■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 RRP1-202ENST00000471909 2544 ntTSL 1 (best)18.2■□□□□ 0.53e-6■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.23e-6■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 RRP1-201ENST00000467112 3019 ntTSL 1 (best)14.94□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 TLK1-204ENST00000413010 603 ntTSL 518.78■□□□□ 0.61e-25■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.526e-7■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 CD37-202ENST00000391859 1588 ntTSL 216.75■□□□□ 0.276e-7■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 CD37-212ENST00000597852 3172 ntTSL 1 (best)15.26■□□□□ 0.036e-7■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.036e-7■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 CD37-208ENST00000595725 1121 ntTSL 213.39□□□□□ -0.276e-7■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 TMBIM1-205ENST00000420341 361 ntTSL 417.1■□□□□ 0.333e-18■■■■□ 19.7
PCBP1Q15365 EIF4G1-208ENST00000413967 2808 ntTSL 218.27■□□□□ 0.528e-8■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 EIF4G1-226ENST00000450424 2658 ntTSL 517.82■□□□□ 0.448e-8■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 EIF4G1-210ENST00000421110 2755 ntTSL 517.47■□□□□ 0.398e-8■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.268e-8■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.168e-8■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.168e-8■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.158e-8■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.088e-8■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 EIF4G1-213ENST00000426123 2907 ntTSL 215.51■□□□□ 0.078e-8■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 EIF4G1-222ENST00000442406 5129 ntTSL 1 (best)14.61□□□□□ -0.078e-8■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.278e-8■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 OBSL1-208ENST00000465149 5380 ntTSL 219.9■□□□□ 0.781e-6■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 GRN-204ENST00000586242 665 ntTSL 317.06■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.12e-7■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 ACSL4-212ENST00000514500 696 ntTSL 515.99■□□□□ 0.151e-17■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 ACSL4-209ENST00000505075 390 ntTSL 36.06□□□□□ -1.441e-17■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 ERF-203ENST00000593944 555 ntTSL 420.8■□□□□ 0.923e-7■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 ERF-204ENST00000595448 557 ntTSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.243e-7■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.442e-9■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.222e-9■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.982e-9■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 SLC25A39-215ENST00000592372 867 ntTSL 318.6■□□□□ 0.572e-9■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.352e-9■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 HSPG2-207ENST00000453796 621 ntTSL 216.18■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 SLC25A39-213ENST00000591006 2217 ntTSL 214.08□□□□□ -0.162e-9■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.342e-22■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.412e-22■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41e-9■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 DENND4B-209ENST00000483561 499 ntTSL 425.55■■□□□ 1.681e-6■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.81e-7■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 TRPM4-209ENST00000598502 3695 ntTSL 1 (best)15.45■□□□□ 0.061e-6■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 TRPM4-211ENST00000598697 3349 ntTSL 215.16■□□□□ 0.021e-6■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 TRPM4-207ENST00000596338 3993 ntTSL 215.13■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 TRPM4-205ENST00000595519 3702 ntTSL 1 (best)14.48□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.27e-8■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.967e-8■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 GRN-205ENST00000586443 1557 ntTSL 320.39■□□□□ 0.852e-6■■■■□ 19.6
PCBP1Q15365 RPLP1-204ENST00000488122 940 ntTSL 223.05■■□□□ 1.282e-26■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.181e-6■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 FDFT1-203ENST00000446331 1558 ntTSL 225.61■■□□□ 1.697e-9■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.227e-9■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.117e-9■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.117e-9■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 FDFT1-207ENST00000525607 1773 ntTSL 220.67■□□□□ 0.97e-9■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.637e-9■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.37e-9■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.127e-9■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.117e-9■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.027e-9■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.227e-9■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 FDFT1-225ENST00000622850 1987 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.57e-9■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.217e-9■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 SEC24C-204ENST00000477008 660 ntTSL 28.16□□□□□ -1.15e-8■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 12e-7■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.971e-20■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.614e-7■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.814e-7■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 SDF4-205ENST00000465727 2095 ntTSL 219.59■□□□□ 0.734e-7■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 PVT1-203ENST00000513868 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.24e-9■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 PVT1-217ENST00000523190 443 ntTSL 37.26□□□□□ -1.254e-9■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 SLC2A4RG-208ENST00000496425 502 ntTSL 219.13■□□□□ 0.654e-6■■■■□ 19.5
PCBP1Q15365 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.271e-64■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 TM9SF4-201ENST00000217315 4032 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.398e-9■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 TM9SF4-207ENST00000495749 3023 ntTSL 29.23□□□□□ -0.938e-9■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.378e-9■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.31e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.061e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.951e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.521e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 TCF25-218ENST00000566283 515 ntTSL 220.55■□□□□ 0.881e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 OPLAH-203ENST00000567871 792 ntTSL 520.03■□□□□ 0.81e-7■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 TCF25-220ENST00000567171 1535 ntTSL 218.6■□□□□ 0.571e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.531e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 SF3B4-202ENST00000457312 826 ntTSL 517.9■□□□□ 0.461e-8■■■■□ 19.4
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 167.3 ms