Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-8■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-8■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 TAOK1-205ENST00000583121 526 ntTSL 39.66□□□□□ -0.863e-8■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 CTTN-204ENST00000393747 1315 ntTSL 517.05■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 CTTN-210ENST00000525852 1470 ntTSL 511.66□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-216ENST00000580888 710 ntTSL 218.07■□□□□ 0.485e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.275e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.155e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-208ENST00000578476 573 ntTSL 215.9■□□□□ 0.145e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-214ENST00000580461 909 ntTSL 212.35□□□□□ -0.435e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-218ENST00000581544 1444 ntTSL 211.53□□□□□ -0.565e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 AC016876.2-201ENST00000581621 4554 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.565e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-213ENST00000579139 568 ntTSL 411.52□□□□□ -0.575e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.65e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.635e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-236ENST00000584901 1021 ntTSL 210.94□□□□□ -0.665e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-226ENST00000582848 591 ntTSL 310.89□□□□□ -0.675e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-223ENST00000582169 552 ntTSL 410.54□□□□□ -0.725e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-229ENST00000583802 563 ntTSL 410.54□□□□□ -0.725e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-231ENST00000584054 716 ntTSL 29.68□□□□□ -0.865e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-215ENST00000580886 562 ntTSL 29.68□□□□□ -0.865e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-232ENST00000584712 782 ntTSL 29.58□□□□□ -0.885e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-233ENST00000584784 818 ntTSL 59.51□□□□□ -0.895e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-209ENST00000578495 916 ntTSL 58.69□□□□□ -1.025e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-212ENST00000579085 569 ntTSL 48.38□□□□□ -1.075e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-237ENST00000585024 577 ntTSL 48.12□□□□□ -1.115e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-202ENST00000396527 1169 ntTSL 28.07□□□□□ -1.125e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-230ENST00000583899 665 ntTSL 36.15□□□□□ -1.425e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-211ENST00000578754 547 ntTSL 45.14□□□□□ -1.595e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 EIF4A1-224ENST00000582213 560 ntTSL 43.73□□□□□ -1.815e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.843e-6■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 LYPLA2-207ENST00000421070 429 ntTSL 515.05■□□□□ -03e-6■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 LYPLA2-209ENST00000492577 717 ntTSL 313.55□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 TOR1A-204ENST00000474192 947 ntTSL 312.96□□□□□ -0.333e-6■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.471e-6■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 HOXA3-205ENST00000522456 503 ntTSL 420.79■□□□□ 0.922e-21■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61e-8■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 THOP1-209ENST00000589087 2977 ntTSL 218.8■□□□□ 0.61e-8■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.571e-8■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.612e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.432e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.342e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 HNRNPL-203ENST00000595164 2404 ntTSL 214.01□□□□□ -0.179e-10■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 HNRNPL-206ENST00000597731 3094 ntTSL 210.97□□□□□ -0.659e-10■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 ESRRA-204ENST00000467987 610 ntTSL 325.96■■□□□ 1.752e-6■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 MGAT5-203ENST00000468758 816 ntTSL 523.66■■□□□ 1.381e-6■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 MGAT5-204ENST00000481801 651 ntTSL 323.66■■□□□ 1.381e-6■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.972e-6■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 HES1-202ENST00000476918 1009 ntTSL 217.81■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.976e-12■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.466e-12■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.044e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.784e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.64e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.554e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 PCYT2-207ENST00000571581 999 ntTSL 524.42■■□□□ 1.54e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.394e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.354e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 PCYT2-213ENST00000573401 1028 ntTSL 523.26■■□□□ 1.314e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 PCYT2-214ENST00000573636 913 ntTSL 522.67■■□□□ 1.224e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 PCYT2-218ENST00000576343 1006 ntTSL 521■□□□□ 0.954e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 MATR3-213ENST00000508689 561 ntTSL 415.37■□□□□ 0.052e-12■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 ETV5-213ENST00000489830 614 ntTSL 27.64□□□□□ -1.195e-7■■■■□ 20.8
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PRPF4O43172 ETV5-208ENST00000472868 238 ntTSL 54□□□□□ -1.775e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 NDUFV1-208ENST00000526770 1748 ntTSL 519.52■□□□□ 0.724e-6■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 SQSTM1-215ENST00000514093 842 ntTSL 519.23■□□□□ 0.671e-8■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 NDUFV1-207ENST00000526169 774 ntTSL 1 (best)18.73■□□□□ 0.594e-6■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 NDUFV1-210ENST00000527923 594 ntTSL 218.34■□□□□ 0.534e-6■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.434e-6■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.264e-6■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.144e-6■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.064e-6■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 NDUFV1-209ENST00000527355 679 ntTSL 213.7□□□□□ -0.224e-6■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 NDUFV1-226ENST00000533919 774 ntTSL 313.7□□□□□ -0.224e-6■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.774e-9■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 ODF3B-206ENST00000437588 276 ntTSL 319.6■□□□□ 0.734e-9■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.234e-9■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.234e-9■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.224e-9■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.214e-9■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 RANBP1-213ENST00000486575 2177 ntTSL 222.35■■□□□ 1.174e-7■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 SUZ12P1-204ENST00000579526 563 ntTSL 220.36■□□□□ 0.856e-7■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.846e-7■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.872e-6■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.191e-6■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 ABCA7-216ENST00000532194 1151 ntTSL 312.12□□□□□ -0.475e-6■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 ABCA7-211ENST00000529442 520 ntTSL 410.7□□□□□ -0.75e-6■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 MSL1-208ENST00000581246 583 ntTSL 410.31□□□□□ -0.763e-9■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 MSL1-201ENST00000339569 3424 ntTSL 24.91□□□□□ -1.623e-9■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.923e-13■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.281e-7■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 TMEM184A-203ENST00000319018 4374 ntTSL 515.43■□□□□ 0.061e-7■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 MBD3-211ENST00000592965 568 ntTSL 422.16■■□□□ 1.145e-7■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 MBD3-204ENST00000585967 583 ntTSL 416.34■□□□□ 0.215e-7■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 ARHGEF11-207ENST00000492592 864 ntTSL 316.21■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 20.7
PRPF4O43172 ARHGEF11-206ENST00000487682 4796 ntTSL 210.73□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 20.7
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