Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ST3GAL4Q11206 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ST3GAL4Q11206 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms