RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601380.2

ANKDD1B-204, Transcript of ankyrin repeat and death domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene ANKDD1B, Length 2,569 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKDD1B-204ENST00000601380 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.25■■■■□ 3.87
ANKDD1B-204ENST00000601380 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.48■■■□□ 2.95
ANKDD1B-204ENST00000601380 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.36■■■□□ 2.93
ANKDD1B-204ENST00000601380 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
ANKDD1B-204ENST00000601380 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
ANKDD1B-204ENST00000601380 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.49■■■□□ 2.79
ANKDD1B-204ENST00000601380 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.26■■■□□ 2.75
ANKDD1B-204ENST00000601380 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.07■■■□□ 2.72
ANKDD1B-204ENST00000601380 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.91■■■□□ 2.7
ANKDD1B-204ENST00000601380 ABCC9O60706 1549 aa31.4■■■□□ 2.62
ANKDD1B-204ENST00000601380 HRCP23327 699 aa31.32■■■□□ 2.6
ANKDD1B-204ENST00000601380 SCRIBQ14160 1630 aa31.23■■■□□ 2.59
ANKDD1B-204ENST00000601380 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.21■■■□□ 2.59
ANKDD1B-204ENST00000601380 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
ANKDD1B-204ENST00000601380 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.06■■■□□ 2.56
ANKDD1B-204ENST00000601380 NACADO15069 1562 aa30.83■■■□□ 2.53
ANKDD1B-204ENST00000601380 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.81■■■□□ 2.52
ANKDD1B-204ENST00000601380 TRIM41Q8WV44 630 aa30.72■■■□□ 2.51
ANKDD1B-204ENST00000601380 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
ANKDD1B-204ENST00000601380 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.53■■■□□ 2.48
ANKDD1B-204ENST00000601380 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
ANKDD1B-204ENST00000601380 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.47■■■□□ 2.47
ANKDD1B-204ENST00000601380 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
ANKDD1B-204ENST00000601380 WIZO95785 1651 aa30.31■■■□□ 2.44
ANKDD1B-204ENST00000601380 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
ANKDD1B-204ENST00000601380 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
ANKDD1B-204ENST00000601380 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.09■■■□□ 2.41
ANKDD1B-204ENST00000601380 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
ANKDD1B-204ENST00000601380 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
ANKDD1B-204ENST00000601380 SMARCA4P51532 1647 aa29.87■■■□□ 2.37
ANKDD1B-204ENST00000601380 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.74■■■□□ 2.35
ANKDD1B-204ENST00000601380 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.74■■■□□ 2.35
ANKDD1B-204ENST00000601380 SMARCA2P51531 1590 aa29.71■■■□□ 2.35
ANKDD1B-204ENST00000601380 ABCC8Q09428 1581 aa29.68■■■□□ 2.34
ANKDD1B-204ENST00000601380 EEA1Q15075 1411 aa29.45■■■□□ 2.31
ANKDD1B-204ENST00000601380 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.3
ANKDD1B-204ENST00000601380 SOGA1O94964 1423 aa29.43■■■□□ 2.3
ANKDD1B-204ENST00000601380 CEP162Q5TB80 1403 aa29.42■■■□□ 2.3
ANKDD1B-204ENST00000601380 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.38■■■□□ 2.29
ANKDD1B-204ENST00000601380 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.38■■■□□ 2.29
ANKDD1B-204ENST00000601380 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.37■■■□□ 2.29
ANKDD1B-204ENST00000601380 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
ANKDD1B-204ENST00000601380 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.34■■■□□ 2.29
ANKDD1B-204ENST00000601380 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
ANKDD1B-204ENST00000601380 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.31■■■□□ 2.28
ANKDD1B-204ENST00000601380 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
ANKDD1B-204ENST00000601380 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.23■■■□□ 2.27
ANKDD1B-204ENST00000601380 GOLGA3Q08378 1498 aa29.22■■■□□ 2.27
ANKDD1B-204ENST00000601380 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
ANKDD1B-204ENST00000601380 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.07■■■□□ 2.24
ANKDD1B-204ENST00000601380 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
ANKDD1B-204ENST00000601380 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKDD1B-204ENST00000601380 SYNJ1O43426 1573 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKDD1B-204ENST00000601380 KIF21BO75037 1637 aa28.98■■■□□ 2.23
ANKDD1B-204ENST00000601380 CLIP1P30622 1438 aa28.87■■■□□ 2.21
ANKDD1B-204ENST00000601380 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
ANKDD1B-204ENST00000601380 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
ANKDD1B-204ENST00000601380 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.76■■■□□ 2.19
ANKDD1B-204ENST00000601380 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.73■■■□□ 2.19
ANKDD1B-204ENST00000601380 TOP2BQ02880 1626 aa28.73■■■□□ 2.19
ANKDD1B-204ENST00000601380 APLP2Q06481 763 aa28.72■■■□□ 2.19
ANKDD1B-204ENST00000601380 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
ANKDD1B-204ENST00000601380 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
ANKDD1B-204ENST00000601380 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.61■■■□□ 2.17
ANKDD1B-204ENST00000601380 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
ANKDD1B-204ENST00000601380 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
ANKDD1B-204ENST00000601380 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
ANKDD1B-204ENST00000601380 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
ANKDD1B-204ENST00000601380 HMGXB3Q12766 1538 aa28.53■■■□□ 2.16
ANKDD1B-204ENST00000601380 NEUROD1Q13562 356 aa28.53■■■□□ 2.16
ANKDD1B-204ENST00000601380 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.52■■■□□ 2.16
ANKDD1B-204ENST00000601380 NCAPD3P42695 1498 aa28.5■■■□□ 2.15
ANKDD1B-204ENST00000601380 PRXQ9BXM0 1461 aa28.47■■■□□ 2.15
ANKDD1B-204ENST00000601380 CUX1P39880 1505 aa28.38■■■□□ 2.13
ANKDD1B-204ENST00000601380 KIF27Q86VH2 1401 aa28.37■■■□□ 2.13
ANKDD1B-204ENST00000601380 ARAP1Q96P48 1450 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKDD1B-204ENST00000601380 CFTRP13569 1480 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKDD1B-204ENST00000601380 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKDD1B-204ENST00000601380 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.21■■■□□ 2.11
ANKDD1B-204ENST00000601380 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
ANKDD1B-204ENST00000601380 MIER1Q8N108 512 aa28.11■■■□□ 2.09
ANKDD1B-204ENST00000601380 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
ANKDD1B-204ENST00000601380 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
ANKDD1B-204ENST00000601380 PRDM2Q13029 1718 aa28.1■■■□□ 2.09
ANKDD1B-204ENST00000601380 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
ANKDD1B-204ENST00000601380 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.08■■■□□ 2.09
ANKDD1B-204ENST00000601380 CUX2O14529 1486 aa28.03■■■□□ 2.08
ANKDD1B-204ENST00000601380 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.99■■■□□ 2.07
ANKDD1B-204ENST00000601380 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.98■■■□□ 2.07
ANKDD1B-204ENST00000601380 IGF1RP08069 1367 aa27.97■■■□□ 2.07
ANKDD1B-204ENST00000601380 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.89■■■□□ 2.06
ANKDD1B-204ENST00000601380 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.88■■■□□ 2.05
ANKDD1B-204ENST00000601380 MAP3K1Q13233 1512 aa27.84■■■□□ 2.05
ANKDD1B-204ENST00000601380 ITGAEP38570 1179 aa27.83■■■□□ 2.05
ANKDD1B-204ENST00000601380 TIAM1Q13009 1591 aa27.83■■■□□ 2.05
ANKDD1B-204ENST00000601380 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.75■■■□□ 2.03
ANKDD1B-204ENST00000601380 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.73■■■□□ 2.03
ANKDD1B-204ENST00000601380 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.72■■■□□ 2.03
ANKDD1B-204ENST00000601380 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.7■■■□□ 2.03
ANKDD1B-204ENST00000601380 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms