RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308197.9

COQ10A-201, Transcript of coenzyme Q10A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene COQ10A, Length 1,652 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ10A-201ENST00000308197 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.02■■■■■ 4.8
COQ10A-201ENST00000308197 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.26■■■■□ 3.87
COQ10A-201ENST00000308197 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
COQ10A-201ENST00000308197 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.33■■■■□ 3.57
COQ10A-201ENST00000308197 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.93■■■■□ 3.5
COQ10A-201ENST00000308197 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.85■■■■□ 3.49
COQ10A-201ENST00000308197 ABCC9O60706 1549 aa36.77■■■■□ 3.48
COQ10A-201ENST00000308197 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.64■■■■□ 3.46
COQ10A-201ENST00000308197 NACADO15069 1562 aa36.5■■■■□ 3.43
COQ10A-201ENST00000308197 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.12■■■■□ 3.37
COQ10A-201ENST00000308197 SCRIBQ14160 1630 aa35.97■■■■□ 3.35
COQ10A-201ENST00000308197 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
COQ10A-201ENST00000308197 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.32■■■■□ 3.24
COQ10A-201ENST00000308197 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.97■■■■□ 3.19
COQ10A-201ENST00000308197 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
COQ10A-201ENST00000308197 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.87■■■■□ 3.17
COQ10A-201ENST00000308197 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
COQ10A-201ENST00000308197 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.72■■■■□ 3.15
COQ10A-201ENST00000308197 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.66■■■■□ 3.14
COQ10A-201ENST00000308197 SMARCA4P51532 1647 aa34.56■■■■□ 3.12
COQ10A-201ENST00000308197 WIZO95785 1651 aa34.43■■■■□ 3.1
COQ10A-201ENST00000308197 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.21■■■■□ 3.07
COQ10A-201ENST00000308197 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
COQ10A-201ENST00000308197 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.04■■■■□ 3.04
COQ10A-201ENST00000308197 SMARCA2P51531 1590 aa33.99■■■■□ 3.03
COQ10A-201ENST00000308197 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.95■■■■□ 3.02
COQ10A-201ENST00000308197 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
COQ10A-201ENST00000308197 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.77■■■■□ 3
COQ10A-201ENST00000308197 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
COQ10A-201ENST00000308197 NCAPD3P42695 1498 aa33.67■■■□□ 2.98
COQ10A-201ENST00000308197 HMGXB3Q12766 1538 aa33.66■■■□□ 2.98
COQ10A-201ENST00000308197 TRIM41Q8WV44 630 aa33.34■■■□□ 2.93
COQ10A-201ENST00000308197 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.34■■■□□ 2.93
COQ10A-201ENST00000308197 ABCC8Q09428 1581 aa33.05■■■□□ 2.88
COQ10A-201ENST00000308197 CFTRP13569 1480 aa32.95■■■□□ 2.87
COQ10A-201ENST00000308197 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.92■■■□□ 2.86
COQ10A-201ENST00000308197 PRDM2Q13029 1718 aa32.83■■■□□ 2.85
COQ10A-201ENST00000308197 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.79■■■□□ 2.84
COQ10A-201ENST00000308197 SYNJ1O43426 1573 aa32.74■■■□□ 2.83
COQ10A-201ENST00000308197 TOP2BQ02880 1626 aa32.66■■■□□ 2.82
COQ10A-201ENST00000308197 EEA1Q15075 1411 aa32.65■■■□□ 2.82
COQ10A-201ENST00000308197 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.64■■■□□ 2.82
COQ10A-201ENST00000308197 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.63■■■□□ 2.81
COQ10A-201ENST00000308197 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.61■■■□□ 2.81
COQ10A-201ENST00000308197 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.5■■■□□ 2.79
COQ10A-201ENST00000308197 SOGA1O94964 1423 aa32.49■■■□□ 2.79
COQ10A-201ENST00000308197 CUX1P39880 1505 aa32.48■■■□□ 2.79
COQ10A-201ENST00000308197 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.4■■■□□ 2.78
COQ10A-201ENST00000308197 NESP48681 1621 aa32.33■■■□□ 2.77
COQ10A-201ENST00000308197 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.33■■■□□ 2.77
COQ10A-201ENST00000308197 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.32■■■□□ 2.76
COQ10A-201ENST00000308197 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.26■■■□□ 2.75
COQ10A-201ENST00000308197 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.23■■■□□ 2.75
COQ10A-201ENST00000308197 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.2■■■□□ 2.75
COQ10A-201ENST00000308197 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.19■■■□□ 2.74
COQ10A-201ENST00000308197 KIF21BO75037 1637 aa32.16■■■□□ 2.74
COQ10A-201ENST00000308197 GOLGA3Q08378 1498 aa32.13■■■□□ 2.73
COQ10A-201ENST00000308197 KIF27Q86VH2 1401 aa32.1■■■□□ 2.73
COQ10A-201ENST00000308197 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.1■■■□□ 2.73
COQ10A-201ENST00000308197 TOPBP1Q92547 1522 aa32.08■■■□□ 2.73
COQ10A-201ENST00000308197 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.07■■■□□ 2.72
COQ10A-201ENST00000308197 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.04■■■□□ 2.72
COQ10A-201ENST00000308197 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.99■■■□□ 2.71
COQ10A-201ENST00000308197 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
COQ10A-201ENST00000308197 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.94■■■□□ 2.7
COQ10A-201ENST00000308197 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
COQ10A-201ENST00000308197 CUX2O14529 1486 aa31.92■■■□□ 2.7
COQ10A-201ENST00000308197 PRXQ9BXM0 1461 aa31.92■■■□□ 2.7
COQ10A-201ENST00000308197 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
COQ10A-201ENST00000308197 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.88■■■□□ 2.69
COQ10A-201ENST00000308197 CEP162Q5TB80 1403 aa31.85■■■□□ 2.69
COQ10A-201ENST00000308197 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.85■■■□□ 2.69
COQ10A-201ENST00000308197 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.79■■■□□ 2.68
COQ10A-201ENST00000308197 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.76■■■□□ 2.67
COQ10A-201ENST00000308197 IGF1RP08069 1367 aa31.75■■■□□ 2.67
COQ10A-201ENST00000308197 WDR97A6NE52 1622 aa31.74■■■□□ 2.67
COQ10A-201ENST00000308197 WDR62O43379 1518 aa31.63■■■□□ 2.65
COQ10A-201ENST00000308197 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.6■■■□□ 2.65
COQ10A-201ENST00000308197 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
COQ10A-201ENST00000308197 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.59■■■□□ 2.65
COQ10A-201ENST00000308197 CLIP1P30622 1438 aa31.58■■■□□ 2.65
COQ10A-201ENST00000308197 CUL7Q14999 1698 aa31.57■■■□□ 2.64
COQ10A-201ENST00000308197 ERCC6Q03468 1493 aa31.56■■■□□ 2.64
COQ10A-201ENST00000308197 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.49■■■□□ 2.63
COQ10A-201ENST00000308197 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
COQ10A-201ENST00000308197 IFT140Q96RY7 1462 aa31.45■■■□□ 2.63
COQ10A-201ENST00000308197 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
COQ10A-201ENST00000308197 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
COQ10A-201ENST00000308197 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.36■■■□□ 2.61
COQ10A-201ENST00000308197 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.35■■■□□ 2.61
COQ10A-201ENST00000308197 PBRM1Q86U86 1689 aa31.3■■■□□ 2.6
COQ10A-201ENST00000308197 GRIN2BQ13224 1484 aa31.25■■■□□ 2.59
COQ10A-201ENST00000308197 ARAP1Q96P48 1450 aa31.23■■■□□ 2.59
COQ10A-201ENST00000308197 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.21■■■□□ 2.592e-7■■■■■ 30
COQ10A-201ENST00000308197 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.2■■■□□ 2.59
COQ10A-201ENST00000308197 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.2■■■□□ 2.59
COQ10A-201ENST00000308197 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.19■■■□□ 2.58
COQ10A-201ENST00000308197 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
COQ10A-201ENST00000308197 ADAMTS12P58397 1594 aa31.16■■■□□ 2.58
COQ10A-201ENST00000308197 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.8 ms