Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCOLN1Q9GZU1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 454.3 ms