RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521182.5

LY6E-210, Transcript of lymphocyte antigen 6 family member E, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LY6E, Length 1,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6E-210ENST00000521182 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.03■■■■■ 4.96
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LY6E-210ENST00000521182 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.07■■■■□ 3.84
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LY6E-210ENST00000521182 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.66■■■■□ 3.78
LY6E-210ENST00000521182 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.56■■■■□ 3.76
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LY6E-210ENST00000521182 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.01■■■■□ 3.68
LY6E-210ENST00000521182 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.97■■■■□ 3.67
LY6E-210ENST00000521182 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.82■■■■□ 3.65
LY6E-210ENST00000521182 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.58■■■■□ 3.61
LY6E-210ENST00000521182 SCRIBQ14160 1630 aa37.4■■■■□ 3.58
LY6E-210ENST00000521182 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
LY6E-210ENST00000521182 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.88■■■■□ 3.49
LY6E-210ENST00000521182 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.77■■■■□ 3.48
LY6E-210ENST00000521182 NCAPD3P42695 1498 aa35.93■■■■□ 3.34
LY6E-210ENST00000521182 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.8■■■■□ 3.32
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LY6E-210ENST00000521182 SMARCA2P51531 1590 aa35.76■■■■□ 3.32
LY6E-210ENST00000521182 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
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LY6E-210ENST00000521182 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.53■■■■□ 3.28
LY6E-210ENST00000521182 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
LY6E-210ENST00000521182 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.39■■■■□ 3.26
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LY6E-210ENST00000521182 NESP48681 1621 aa35.08■■■■□ 3.21
LY6E-210ENST00000521182 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.04■■■■□ 3.2
LY6E-210ENST00000521182 WIZO95785 1651 aa34.95■■■■□ 3.18
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LY6E-210ENST00000521182 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
LY6E-210ENST00000521182 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.84■■■■□ 3.17
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LY6E-210ENST00000521182 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
LY6E-210ENST00000521182 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.63■■■■□ 3.13
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LY6E-210ENST00000521182 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.47■■■■□ 3.11
LY6E-210ENST00000521182 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.4■■■■□ 3.1
LY6E-210ENST00000521182 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.39■■■■□ 3.1
LY6E-210ENST00000521182 WDR62O43379 1518 aa34.37■■■■□ 3.09
LY6E-210ENST00000521182 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.21■■■■□ 3.07
LY6E-210ENST00000521182 PRDM2Q13029 1718 aa34.08■■■■□ 3.05
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LY6E-210ENST00000521182 ABCC8Q09428 1581 aa33.85■■■■□ 3.01
LY6E-210ENST00000521182 TOPBP1Q92547 1522 aa33.75■■■□□ 2.99
LY6E-210ENST00000521182 IFT140Q96RY7 1462 aa33.75■■■□□ 2.99
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LY6E-210ENST00000521182 OSCARQ8IYS5 282 aa33.63■■■□□ 2.97
LY6E-210ENST00000521182 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
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LY6E-210ENST00000521182 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
LY6E-210ENST00000521182 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
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LY6E-210ENST00000521182 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.24■■■□□ 2.91
LY6E-210ENST00000521182 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.24■■■□□ 2.91
LY6E-210ENST00000521182 WDR97A6NE52 1622 aa33.24■■■□□ 2.91
LY6E-210ENST00000521182 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
LY6E-210ENST00000521182 FBLN2P98095 1184 aa33.04■■■□□ 2.88
LY6E-210ENST00000521182 CHD1O14646 1710 aa33.02■■■□□ 2.88
LY6E-210ENST00000521182 GRIN2BQ13224 1484 aa33.01■■■□□ 2.88
LY6E-210ENST00000521182 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
LY6E-210ENST00000521182 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33■■■□□ 2.87
LY6E-210ENST00000521182 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33■■■□□ 2.87
LY6E-210ENST00000521182 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33■■■□□ 2.87
LY6E-210ENST00000521182 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.98■■■□□ 2.87
LY6E-210ENST00000521182 ARHGEF11O15085 1522 aa32.97■■■□□ 2.87
LY6E-210ENST00000521182 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.95■■■□□ 2.87
LY6E-210ENST00000521182 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
LY6E-210ENST00000521182 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.92■■■□□ 2.86
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LY6E-210ENST00000521182 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.81■■■□□ 2.84
LY6E-210ENST00000521182 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.8■■■□□ 2.84
LY6E-210ENST00000521182 SYNJ1O43426 1573 aa32.79■■■□□ 2.84
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LY6E-210ENST00000521182 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.54■■■□□ 2.8
LY6E-210ENST00000521182 ADAMTS12P58397 1594 aa32.53■■■□□ 2.8
LY6E-210ENST00000521182 NUP160Q12769 1436 aa32.46■■■□□ 2.79
LY6E-210ENST00000521182 CEP170Q5SW79 1584 aa32.35■■■□□ 2.77
LY6E-210ENST00000521182 KIF27Q86VH2 1401 aa32.27■■■□□ 2.76
LY6E-210ENST00000521182 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
LY6E-210ENST00000521182 SHROOM2Q13796 1616 aa32.24■■■□□ 2.75
LY6E-210ENST00000521182 IGF1RP08069 1367 aa32.21■■■□□ 2.75
LY6E-210ENST00000521182 JPH4Q96JJ6 628 aa32.16■■■□□ 2.74
LY6E-210ENST00000521182 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.15■■■□□ 2.74
LY6E-210ENST00000521182 CUL7Q14999 1698 aa32.11■■■□□ 2.73
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