Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ6

GEMIN5, Gem-associated protein 5, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN5Q8TEQ6 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.142e-8■■■■□ 20.6
GEMIN5Q8TEQ6 SUB1-212ENST00000513013 493 ntTSL 50.23□□□□□ -2.372e-8■■■■□ 20.6
GEMIN5Q8TEQ6 ACTB-203ENST00000417101 472 ntTSL 435.92■■■■□ 3.345e-34■■■■□ 20.6
GEMIN5Q8TEQ6 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.521e-6■■■■□ 20.6
GEMIN5Q8TEQ6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.841e-6■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 H2AFX-201ENST00000375167 1373 ntTSL 230.18■■■□□ 2.421e-6■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.185e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-214ENST00000548273 818 ntTSL 321.54■■□□□ 1.045e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.895e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.735e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-217ENST00000549988 544 ntTSL 319.63■□□□□ 0.735e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-205ENST00000542344 1675 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.455e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-210ENST00000547773 1967 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.365e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-209ENST00000547704 760 ntTSL 517.23■□□□□ 0.355e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-221ENST00000551600 786 ntTSL 517.23■□□□□ 0.355e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-215ENST00000549479 573 ntTSL 216.91■□□□□ 0.35e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.275e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-213ENST00000548044 1339 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.265e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-207ENST00000547479 623 ntTSL 516.09■□□□□ 0.175e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-216ENST00000549596 1838 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.125e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-203ENST00000431879 2031 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.235e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-219ENST00000551500 552 ntTSL 1 (best)9.42□□□□□ -0.95e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.925e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.385e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 NAP1L1-218ENST00000550934 851 ntTSL 50.34□□□□□ -2.355e-12■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.541e-7■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.011e-7■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.661e-7■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.361e-7■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 FOSL1-205ENST00000534222 584 ntTSL 322.25■■□□□ 1.151e-7■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 223.16■■□□□ 1.31e-10■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.692e-6■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.512e-6■■■■□ 20.5
GEMIN5Q8TEQ6 CBX4-203ENST00000494546 432 ntTSL 353.84■■■■■ 6.212e-9■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 NSD2-216ENST00000507820 528 ntTSL 520.93■□□□□ 0.946e-9■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 NSD2-218ENST00000508355 2092 ntTSL 1 (best)20.5■□□□□ 0.876e-9■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.686e-9■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.691e-6■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.716e-7■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.646e-7■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.681e-6■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 CDC45-211ENST00000491520 723 ntTSL 531.34■■■□□ 2.611e-10■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 CDC45-209ENST00000483431 712 ntTSL 527.27■■□□□ 1.961e-10■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 CDC45-207ENST00000455750 568 ntTSL 220.99■□□□□ 0.951e-10■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 CDC45-206ENST00000438587 552 ntTSL 411.11□□□□□ -0.631e-10■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 PHF13-202ENST00000495385 798 ntTSL 332.63■■■□□ 2.812e-6■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 FGD5-AS1-201ENST00000417835 1630 ntTSL 1 (best)35.34■■■■□ 3.259e-9■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 MAFG-203ENST00000574686 570 ntTSL 536.42■■■■□ 3.423e-6■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 CALM3-213ENST00000602169 590 ntTSL 220.68■□□□□ 0.91e-10■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.831e-10■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 CALM3-210ENST00000597868 927 ntTSL 317.64■□□□□ 0.411e-10■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 RPL4-217ENST00000569696 569 ntTSL 518.49■□□□□ 0.557e-12■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 RPL4-214ENST00000567229 2003 ntTSL 518.21■□□□□ 0.517e-12■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.397e-12■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 RPL4-210ENST00000566039 1099 ntTSL 214.73□□□□□ -0.057e-12■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.197e-12■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 511.84□□□□□ -0.517e-12■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.025e-9■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 HIPK1-206ENST00000369559 3424 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.45e-9■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.545e-9■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.815e-9■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.632e-6■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC30.86■■■□□ 2.532e-8■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.026e-7■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.16e-7■■■■□ 20.4
GEMIN5Q8TEQ6 RHBDL1-203ENST00000450775 1566 ntTSL 238.15■■■■□ 3.76e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDXR-218ENST00000583881 1561 ntTSL 232.08■■■□□ 2.736e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.716e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.566e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDXR-206ENST00000577509 1912 ntTSL 230.58■■■□□ 2.496e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 YIF1A-212ENST00000528575 532 ntTSL 330.37■■■□□ 2.456e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 APH1A-201ENST00000236017 663 ntTSL 229.71■■■□□ 2.356e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.316e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDXR-209ENST00000579482 2157 ntTSL 228.68■■■□□ 2.186e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.176e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.156e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDXR-208ENST00000578473 2482 ntTSL 1 (best)28.32■■■□□ 2.126e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.096e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.986e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.846e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.816e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.729e-7■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 YIF1A-204ENST00000431556 619 ntTSL 225.22■■□□□ 1.636e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.66e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 COPS3-207ENST00000477299 656 ntTSL 525.04■■□□□ 1.66e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 COPS3-210ENST00000492672 809 ntTSL 425.04■■□□□ 1.66e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDPS-205ENST00000465559 677 ntTSL 324.81■■□□□ 1.566e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDPS-208ENST00000470171 746 ntTSL 224.71■■□□□ 1.556e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.536e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.526e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.56e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.476e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 SFSWAP-206ENST00000537582 1576 ntTSL 224.08■■□□□ 1.456e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDPS-210ENST00000474345 713 ntTSL 323.94■■□□□ 1.426e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDPS-213ENST00000489003 976 ntTSL 223.94■■□□□ 1.426e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.426e-8■■■■□ 20.3
GEMIN5Q8TEQ6 FDPS-212ENST00000487002 2017 ntTSL 223.76■■□□□ 1.396e-8■■■■□ 20.3
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