RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495385.1

PHF13-202, Transcript of PHD finger protein 13, humanhuman

TSL 3

Gene PHF13, Length 798 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13-202ENST00000495385 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.34■■■■■ 5.49
PHF13-202ENST00000495385 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.41■■■■■ 4.7
PHF13-202ENST00000495385 ABCC9O60706 1549 aa44.01■■■■■ 4.64
PHF13-202ENST00000495385 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.05■■■■■ 4.32
PHF13-202ENST00000495385 NACADO15069 1562 aa41.78■■■■■ 4.28
PHF13-202ENST00000495385 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.41■■■■■ 4.22
PHF13-202ENST00000495385 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.27■■■■■ 4.2
PHF13-202ENST00000495385 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.22■■■■■ 4.19
PHF13-202ENST00000495385 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.05■■■■■ 4.16
PHF13-202ENST00000495385 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
PHF13-202ENST00000495385 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.91■■■■■ 4.14
PHF13-202ENST00000495385 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.84■■■■■ 4.13
PHF13-202ENST00000495385 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.82■■■■■ 4.12
PHF13-202ENST00000495385 SCRIBQ14160 1630 aa40.38■■■■■ 4.05
PHF13-202ENST00000495385 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.3■■■■■ 4.04
PHF13-202ENST00000495385 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.89■■■■□ 3.98
PHF13-202ENST00000495385 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
PHF13-202ENST00000495385 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.62■■■■□ 3.93
PHF13-202ENST00000495385 SMARCA4P51532 1647 aa38.56■■■■□ 3.76
PHF13-202ENST00000495385 NCAPD3P42695 1498 aa38.49■■■■□ 3.75
PHF13-202ENST00000495385 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.42■■■■□ 3.74
PHF13-202ENST00000495385 SMARCA2P51531 1590 aa38.36■■■■□ 3.73
PHF13-202ENST00000495385 HMGXB3Q12766 1538 aa38.36■■■■□ 3.73
PHF13-202ENST00000495385 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
PHF13-202ENST00000495385 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.19■■■■□ 3.7
PHF13-202ENST00000495385 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
PHF13-202ENST00000495385 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.04■■■■□ 3.68
PHF13-202ENST00000495385 ERCC6Q03468 1493 aa37.94■■■■□ 3.66
PHF13-202ENST00000495385 NESP48681 1621 aa37.9■■■■□ 3.66
PHF13-202ENST00000495385 CUX2O14529 1486 aa37.9■■■■□ 3.66
PHF13-202ENST00000495385 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.72■■■■□ 3.63
PHF13-202ENST00000495385 WIZO95785 1651 aa37.68■■■■□ 3.62
PHF13-202ENST00000495385 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
PHF13-202ENST00000495385 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.62■■■■□ 3.61
PHF13-202ENST00000495385 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.52■■■■□ 3.6
PHF13-202ENST00000495385 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.31■■■■□ 3.56
PHF13-202ENST00000495385 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.27■■■■□ 3.56
PHF13-202ENST00000495385 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
PHF13-202ENST00000495385 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
PHF13-202ENST00000495385 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.08■■■■□ 3.53
PHF13-202ENST00000495385 WDR62O43379 1518 aa37.08■■■■□ 3.53
PHF13-202ENST00000495385 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.97■■■■□ 3.51
PHF13-202ENST00000495385 PRDM2Q13029 1718 aa36.96■■■■□ 3.51
PHF13-202ENST00000495385 CFTRP13569 1480 aa36.96■■■■□ 3.51
PHF13-202ENST00000495385 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.92■■■■□ 3.5
PHF13-202ENST00000495385 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
PHF13-202ENST00000495385 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.63■■■■□ 3.45
PHF13-202ENST00000495385 TOPBP1Q92547 1522 aa36.29■■■■□ 3.4
PHF13-202ENST00000495385 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.22■■■■□ 3.39
PHF13-202ENST00000495385 IFT140Q96RY7 1462 aa36.19■■■■□ 3.38
PHF13-202ENST00000495385 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
PHF13-202ENST00000495385 ABCC8Q09428 1581 aa36.14■■■■□ 3.38
PHF13-202ENST00000495385 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
PHF13-202ENST00000495385 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
PHF13-202ENST00000495385 OSCARQ8IYS5 282 aa35.96■■■■□ 3.35
PHF13-202ENST00000495385 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
PHF13-202ENST00000495385 TRIM41Q8WV44 630 aa35.89■■■■□ 3.34
PHF13-202ENST00000495385 CHD1O14646 1710 aa35.88■■■■□ 3.34
PHF13-202ENST00000495385 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.82■■■■□ 3.32
PHF13-202ENST00000495385 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.82■■■■□ 3.32
PHF13-202ENST00000495385 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.82■■■■□ 3.32
PHF13-202ENST00000495385 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.77■■■■□ 3.324e-6■■■□□ 16.1
PHF13-202ENST00000495385 CUX1P39880 1505 aa35.75■■■■□ 3.31
PHF13-202ENST00000495385 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.74■■■■□ 3.31
PHF13-202ENST00000495385 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.72■■■■□ 3.31
PHF13-202ENST00000495385 WDR97A6NE52 1622 aa35.7■■■■□ 3.31
PHF13-202ENST00000495385 ARHGEF11O15085 1522 aa35.65■■■■□ 3.3
PHF13-202ENST00000495385 SOGA1O94964 1423 aa35.63■■■■□ 3.29
PHF13-202ENST00000495385 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
PHF13-202ENST00000495385 PBRM1Q86U86 1689 aa35.52■■■■□ 3.28
PHF13-202ENST00000495385 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.49■■■■□ 3.27
PHF13-202ENST00000495385 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
PHF13-202ENST00000495385 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
PHF13-202ENST00000495385 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.39■■■■□ 3.26
PHF13-202ENST00000495385 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.37■■■■□ 3.25
PHF13-202ENST00000495385 GRIN2BQ13224 1484 aa35.37■■■■□ 3.25
PHF13-202ENST00000495385 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.34■■■■□ 3.25
PHF13-202ENST00000495385 FBLN2P98095 1184 aa35.33■■■■□ 3.25
PHF13-202ENST00000495385 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.32■■■■□ 3.24
PHF13-202ENST00000495385 ARAP1Q96P48 1450 aa35.31■■■■□ 3.24
PHF13-202ENST00000495385 SYNJ1O43426 1573 aa35.3■■■■□ 3.24
PHF13-202ENST00000495385 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.27■■■■□ 3.24
PHF13-202ENST00000495385 SYNJ2O15056 1496 aa35.26■■■■□ 3.23
PHF13-202ENST00000495385 TOP2BQ02880 1626 aa35.25■■■■□ 3.23
PHF13-202ENST00000495385 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.11■■■■□ 3.21
PHF13-202ENST00000495385 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
PHF13-202ENST00000495385 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.1■■■■□ 3.21
PHF13-202ENST00000495385 ADAMTS12P58397 1594 aa35.09■■■■□ 3.21
PHF13-202ENST00000495385 GRIN2AQ12879 1464 aa34.97■■■■□ 3.19
PHF13-202ENST00000495385 CEP170Q5SW79 1584 aa34.93■■■■□ 3.18
PHF13-202ENST00000495385 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.9■■■■□ 3.18
PHF13-202ENST00000495385 NUP160Q12769 1436 aa34.84■■■■□ 3.17
PHF13-202ENST00000495385 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.83■■■■□ 3.17
PHF13-202ENST00000495385 SHROOM2Q13796 1616 aa34.82■■■■□ 3.16
PHF13-202ENST00000495385 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.81■■■■□ 3.16
PHF13-202ENST00000495385 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
PHF13-202ENST00000495385 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.62■■■■□ 3.13
PHF13-202ENST00000495385 CUL7Q14999 1698 aa34.51■■■■□ 3.12
PHF13-202ENST00000495385 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
PHF13-202ENST00000495385 KIF27Q86VH2 1401 aa34.38■■■■□ 3.09
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