RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450775.2

RHBDL1-203, Transcript of rhomboid like 1, humanhuman

TSL 2

Gene RHBDL1, Length 1,566 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL1-203ENST00000450775 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.15■■■■■ 6.9
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RHBDL1-203ENST00000450775 ABCC9O60706 1549 aa48.87■■■■■ 5.41
RHBDL1-203ENST00000450775 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
RHBDL1-203ENST00000450775 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.18■■■■■ 5.3
RHBDL1-203ENST00000450775 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.06■■■■■ 5.28
RHBDL1-203ENST00000450775 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.91■■■■■ 5.26
RHBDL1-203ENST00000450775 NACADO15069 1562 aa47.82■■■■■ 5.25
RHBDL1-203ENST00000450775 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.6■■■■■ 5.21
RHBDL1-203ENST00000450775 SCRIBQ14160 1630 aa46.84■■■■■ 5.09
RHBDL1-203ENST00000450775 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.69■■■■■ 5.07
RHBDL1-203ENST00000450775 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.66■■■■■ 5.06
RHBDL1-203ENST00000450775 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.1■■■■■ 4.97
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RHBDL1-203ENST00000450775 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.14■■■■■ 4.82
RHBDL1-203ENST00000450775 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
RHBDL1-203ENST00000450775 SMARCA4P51532 1647 aa44.91■■■■■ 4.78
RHBDL1-203ENST00000450775 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.84■■■■■ 4.77
RHBDL1-203ENST00000450775 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
RHBDL1-203ENST00000450775 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
RHBDL1-203ENST00000450775 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
RHBDL1-203ENST00000450775 WIZO95785 1651 aa44.49■■■■■ 4.71
RHBDL1-203ENST00000450775 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.42■■■■■ 4.7
RHBDL1-203ENST00000450775 SMARCA2P51531 1590 aa44.34■■■■■ 4.69
RHBDL1-203ENST00000450775 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.31■■■■■ 4.68
RHBDL1-203ENST00000450775 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.28■■■■■ 4.68
RHBDL1-203ENST00000450775 NCAPD3P42695 1498 aa44.06■■■■■ 4.64
RHBDL1-203ENST00000450775 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
RHBDL1-203ENST00000450775 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
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RHBDL1-203ENST00000450775 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.65■■■■■ 4.58
RHBDL1-203ENST00000450775 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.49■■■■■ 4.55
RHBDL1-203ENST00000450775 CFTRP13569 1480 aa42.86■■■■■ 4.45
RHBDL1-203ENST00000450775 PRDM2Q13029 1718 aa42.85■■■■■ 4.45
RHBDL1-203ENST00000450775 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.84■■■■■ 4.45
RHBDL1-203ENST00000450775 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.77■■■■■ 4.44
RHBDL1-203ENST00000450775 NESP48681 1621 aa42.66■■■■■ 4.42
RHBDL1-203ENST00000450775 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.39■■■■■ 4.38
RHBDL1-203ENST00000450775 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.38■■■■■ 4.37
RHBDL1-203ENST00000450775 ABCC8Q09428 1581 aa42.33■■■■■ 4.37
RHBDL1-203ENST00000450775 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.31■■■■■ 4.36
RHBDL1-203ENST00000450775 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.29■■■■■ 4.36
RHBDL1-203ENST00000450775 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.23■■■■■ 4.35
RHBDL1-203ENST00000450775 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.18■■■■■ 4.34
RHBDL1-203ENST00000450775 SYNJ1O43426 1573 aa42.05■■■■■ 4.32
RHBDL1-203ENST00000450775 ERCC6Q03468 1493 aa42.04■■■■■ 4.32
RHBDL1-203ENST00000450775 TRIM41Q8WV44 630 aa42.02■■■■■ 4.32
RHBDL1-203ENST00000450775 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.02■■■■■ 4.32
RHBDL1-203ENST00000450775 TOP2BQ02880 1626 aa42■■■■■ 4.31
RHBDL1-203ENST00000450775 CUX1P39880 1505 aa42■■■■■ 4.31
RHBDL1-203ENST00000450775 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.94■■■■■ 4.3
RHBDL1-203ENST00000450775 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.9■■■■■ 4.3
RHBDL1-203ENST00000450775 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.3
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RHBDL1-203ENST00000450775 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
RHBDL1-203ENST00000450775 WDR62O43379 1518 aa41.74■■■■■ 4.27
RHBDL1-203ENST00000450775 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.66■■■■■ 4.26
RHBDL1-203ENST00000450775 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
RHBDL1-203ENST00000450775 SOGA1O94964 1423 aa41.4■■■■■ 4.22
RHBDL1-203ENST00000450775 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.37■■■■■ 4.21
RHBDL1-203ENST00000450775 WDR97A6NE52 1622 aa41.36■■■■■ 4.21
RHBDL1-203ENST00000450775 CUX2O14529 1486 aa41.35■■■■■ 4.21
RHBDL1-203ENST00000450775 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
RHBDL1-203ENST00000450775 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.31■■■■■ 4.2
RHBDL1-203ENST00000450775 IFT140Q96RY7 1462 aa41.27■■■■■ 4.2
RHBDL1-203ENST00000450775 EEA1Q15075 1411 aa41.24■■■■■ 4.19
RHBDL1-203ENST00000450775 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.2■■■■■ 4.19
RHBDL1-203ENST00000450775 KIF27Q86VH2 1401 aa41.2■■■■■ 4.19
RHBDL1-203ENST00000450775 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
RHBDL1-203ENST00000450775 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.09■■■■■ 4.17
RHBDL1-203ENST00000450775 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
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RHBDL1-203ENST00000450775 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.96■■■■■ 4.15
RHBDL1-203ENST00000450775 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.15
RHBDL1-203ENST00000450775 PBRM1Q86U86 1689 aa40.93■■■■■ 4.14
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RHBDL1-203ENST00000450775 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.55■■■■■ 4.08
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RHBDL1-203ENST00000450775 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.51■■■■■ 4.08
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RHBDL1-203ENST00000450775 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
RHBDL1-203ENST00000450775 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.28■■■■■ 4.04
RHBDL1-203ENST00000450775 GRIN2AQ12879 1464 aa40.28■■■■■ 4.04
RHBDL1-203ENST00000450775 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.26■■■■■ 4.04
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RHBDL1-203ENST00000450775 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
RHBDL1-203ENST00000450775 FBLN2P98095 1184 aa40.17■■■■■ 4.02
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