RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450775.2

RHBDL1-203, Transcript of rhomboid like 1, humanhuman

TSL 2

Gene RHBDL1, Length 1,566 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL1-203ENST00000450775 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.15■■■■■ 6.9
RHBDL1-203ENST00000450775 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.25■■■■■ 5.79
RHBDL1-203ENST00000450775 ABCC9O60706 1549 aa48.87■■■■■ 5.41
RHBDL1-203ENST00000450775 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
RHBDL1-203ENST00000450775 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.18■■■■■ 5.3
RHBDL1-203ENST00000450775 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.06■■■■■ 5.28
RHBDL1-203ENST00000450775 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.91■■■■■ 5.26
RHBDL1-203ENST00000450775 NACADO15069 1562 aa47.82■■■■■ 5.25
RHBDL1-203ENST00000450775 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.6■■■■■ 5.21
RHBDL1-203ENST00000450775 SCRIBQ14160 1630 aa46.84■■■■■ 5.09
RHBDL1-203ENST00000450775 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.69■■■■■ 5.07
RHBDL1-203ENST00000450775 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.66■■■■■ 5.06
RHBDL1-203ENST00000450775 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.1■■■■■ 4.97
RHBDL1-203ENST00000450775 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.83■■■■■ 4.93
RHBDL1-203ENST00000450775 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.14■■■■■ 4.82
RHBDL1-203ENST00000450775 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
RHBDL1-203ENST00000450775 SMARCA4P51532 1647 aa44.91■■■■■ 4.78
RHBDL1-203ENST00000450775 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.84■■■■■ 4.77
RHBDL1-203ENST00000450775 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
RHBDL1-203ENST00000450775 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
RHBDL1-203ENST00000450775 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
RHBDL1-203ENST00000450775 WIZO95785 1651 aa44.49■■■■■ 4.71
RHBDL1-203ENST00000450775 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.42■■■■■ 4.7
RHBDL1-203ENST00000450775 SMARCA2P51531 1590 aa44.34■■■■■ 4.69
RHBDL1-203ENST00000450775 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.31■■■■■ 4.68
RHBDL1-203ENST00000450775 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.28■■■■■ 4.68
RHBDL1-203ENST00000450775 NCAPD3P42695 1498 aa44.06■■■■■ 4.64
RHBDL1-203ENST00000450775 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
RHBDL1-203ENST00000450775 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
RHBDL1-203ENST00000450775 HMGXB3Q12766 1538 aa44.01■■■■■ 4.64
RHBDL1-203ENST00000450775 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.65■■■■■ 4.58
RHBDL1-203ENST00000450775 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.49■■■■■ 4.55
RHBDL1-203ENST00000450775 CFTRP13569 1480 aa42.86■■■■■ 4.45
RHBDL1-203ENST00000450775 PRDM2Q13029 1718 aa42.85■■■■■ 4.45
RHBDL1-203ENST00000450775 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.84■■■■■ 4.45
RHBDL1-203ENST00000450775 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.77■■■■■ 4.44
RHBDL1-203ENST00000450775 NESP48681 1621 aa42.66■■■■■ 4.42
RHBDL1-203ENST00000450775 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.39■■■■■ 4.38
RHBDL1-203ENST00000450775 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.38■■■■■ 4.37
RHBDL1-203ENST00000450775 ABCC8Q09428 1581 aa42.33■■■■■ 4.37
RHBDL1-203ENST00000450775 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.31■■■■■ 4.36
RHBDL1-203ENST00000450775 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.29■■■■■ 4.36
RHBDL1-203ENST00000450775 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.23■■■■■ 4.35
RHBDL1-203ENST00000450775 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.18■■■■■ 4.34
RHBDL1-203ENST00000450775 SYNJ1O43426 1573 aa42.05■■■■■ 4.32
RHBDL1-203ENST00000450775 ERCC6Q03468 1493 aa42.04■■■■■ 4.32
RHBDL1-203ENST00000450775 TRIM41Q8WV44 630 aa42.02■■■■■ 4.32
RHBDL1-203ENST00000450775 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.02■■■■■ 4.32
RHBDL1-203ENST00000450775 TOP2BQ02880 1626 aa42■■■■■ 4.31
RHBDL1-203ENST00000450775 CUX1P39880 1505 aa42■■■■■ 4.31
RHBDL1-203ENST00000450775 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.94■■■■■ 4.3
RHBDL1-203ENST00000450775 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.9■■■■■ 4.3
RHBDL1-203ENST00000450775 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.3
RHBDL1-203ENST00000450775 TOPBP1Q92547 1522 aa41.85■■■■■ 4.29
RHBDL1-203ENST00000450775 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
RHBDL1-203ENST00000450775 WDR62O43379 1518 aa41.74■■■■■ 4.27
RHBDL1-203ENST00000450775 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.66■■■■■ 4.26
RHBDL1-203ENST00000450775 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
RHBDL1-203ENST00000450775 SOGA1O94964 1423 aa41.4■■■■■ 4.22
RHBDL1-203ENST00000450775 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.37■■■■■ 4.21
RHBDL1-203ENST00000450775 WDR97A6NE52 1622 aa41.36■■■■■ 4.21
RHBDL1-203ENST00000450775 CUX2O14529 1486 aa41.35■■■■■ 4.21
RHBDL1-203ENST00000450775 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
RHBDL1-203ENST00000450775 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.31■■■■■ 4.2
RHBDL1-203ENST00000450775 IFT140Q96RY7 1462 aa41.27■■■■■ 4.2
RHBDL1-203ENST00000450775 EEA1Q15075 1411 aa41.24■■■■■ 4.19
RHBDL1-203ENST00000450775 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.2■■■■■ 4.19
RHBDL1-203ENST00000450775 KIF27Q86VH2 1401 aa41.2■■■■■ 4.19
RHBDL1-203ENST00000450775 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
RHBDL1-203ENST00000450775 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.09■■■■■ 4.17
RHBDL1-203ENST00000450775 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
RHBDL1-203ENST00000450775 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
RHBDL1-203ENST00000450775 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.97■■■■■ 4.15
RHBDL1-203ENST00000450775 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.96■■■■■ 4.15
RHBDL1-203ENST00000450775 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.15
RHBDL1-203ENST00000450775 PBRM1Q86U86 1689 aa40.93■■■■■ 4.14
RHBDL1-203ENST00000450775 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.89■■■■■ 4.14
RHBDL1-203ENST00000450775 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.86■■■■■ 4.13
RHBDL1-203ENST00000450775 IGF1RP08069 1367 aa40.83■■■■■ 4.13
RHBDL1-203ENST00000450775 CUL7Q14999 1698 aa40.79■■■■■ 4.12
RHBDL1-203ENST00000450775 GRIN2BQ13224 1484 aa40.79■■■■■ 4.12
RHBDL1-203ENST00000450775 KIF21BO75037 1637 aa40.78■■■■■ 4.12
RHBDL1-203ENST00000450775 PRXQ9BXM0 1461 aa40.7■■■■■ 4.11
RHBDL1-203ENST00000450775 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.64■■■■■ 4.1
RHBDL1-203ENST00000450775 ADAMTS12P58397 1594 aa40.6■■■■■ 4.09
RHBDL1-203ENST00000450775 GOLGA3Q08378 1498 aa40.6■■■■■ 4.09
RHBDL1-203ENST00000450775 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.57■■■■■ 4.09
RHBDL1-203ENST00000450775 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.08
RHBDL1-203ENST00000450775 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.57■■■■■ 4.08
RHBDL1-203ENST00000450775 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.55■■■■■ 4.08
RHBDL1-203ENST00000450775 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.53■■■■■ 4.08
RHBDL1-203ENST00000450775 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.51■■■■■ 4.08
RHBDL1-203ENST00000450775 SYNJ2O15056 1496 aa40.38■■■■■ 4.06
RHBDL1-203ENST00000450775 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
RHBDL1-203ENST00000450775 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.28■■■■■ 4.04
RHBDL1-203ENST00000450775 GRIN2AQ12879 1464 aa40.28■■■■■ 4.04
RHBDL1-203ENST00000450775 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.26■■■■■ 4.04
RHBDL1-203ENST00000450775 CHD1O14646 1710 aa40.26■■■■■ 4.03
RHBDL1-203ENST00000450775 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
RHBDL1-203ENST00000450775 FBLN2P98095 1184 aa40.17■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.8 ms