Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NIPBLQ6KC79 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.511e-5■□□□□ 11.1
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NIPBLQ6KC79 BLOC1S5-TXNDC5-201ENST00000439343 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.031e-6■□□□□ 11.1
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NIPBLQ6KC79 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.051e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.061e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.061e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 GLUL-206ENST00000462444 793 ntTSL 28.4□□□□□ -1.061e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 GLUL-207ENST00000463851 939 ntTSL 38.37□□□□□ -1.071e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 RPS20-207ENST00000520627 423 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.091e-7■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.092e-8■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 SEM1-205ENST00000444799 1590 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.11e-5■□□□□ 11.1
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NIPBLQ6KC79 SEM1-214ENST00000613919 610 ntTSL 28.12□□□□□ -1.111e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 CIT-202ENST00000392520 5205 ntTSL 58.03□□□□□ -1.121e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 SEM1-206ENST00000449279 699 ntTSL 37.97□□□□□ -1.131e-5■□□□□ 11.1
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NIPBLQ6KC79 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.141e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.151e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 SLTM-226ENST00000628684 1040 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.161e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 SCML2-201ENST00000251900 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.161e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 SLTM-212ENST00000557924 3021 ntTSL 27.78□□□□□ -1.161e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 SLTM-202ENST00000380516 4147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.161e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 RARS-201ENST00000231572 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.181e-5■□□□□ 11.1
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