Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.053e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 RPS15-204ENST00000586656 436 ntTSL 314.54□□□□□ -0.083e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.113e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 RPS15-213ENST00000617694 338 ntTSL 310.85□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.662e-9■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 PNISR-209ENST00000492294 652 ntTSL 35.93□□□□□ -1.464e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 PNISR-205ENST00000466057 2850 ntTSL 1 (best)5.64□□□□□ -1.514e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 PNISR-210ENST00000498075 1027 ntTSL 1 (best)5.12□□□□□ -1.594e-8■□□□□ 10.4
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TRA2AQ13595 SNHG1-215ENST00000540904 594 ntTSL 59.01□□□□□ -0.976e-56■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.981e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 DCAF8-207ENST00000447377 728 ntTSL 217.88■□□□□ 0.451e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.261e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 DCAF8-204ENST00000407642 517 ntTSL 210.36□□□□□ -0.751e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 DCAF8-216ENST00000495887 919 ntTSL 39.95□□□□□ -0.821e-8■□□□□ 10.4
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TRA2AQ13595 DCAF8-206ENST00000440682 501 ntTSL 37.18□□□□□ -1.261e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 CXXC1-216ENST00000591474 845 ntTSL 322.49■■□□□ 1.195e-7■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 CXXC1-215ENST00000591190 1021 ntTSL 315.54■□□□□ 0.085e-7■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 CXXC1-217ENST00000592078 686 ntTSL 215.26■□□□□ 0.035e-7■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 HNRNPC-228ENST00000557033 760 ntTSL 39.68□□□□□ -0.868e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 HNRNPC-215ENST00000555127 929 ntTSL 26.31□□□□□ -1.48e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 UBC-209ENST00000541272 582 ntTSL 511.9□□□□□ -0.52e-10■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 MRE11-205ENST00000535120 234 ntTSL 27.22□□□□□ -1.257e-7■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.297e-7■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.497e-7■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.527e-7■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.697e-7■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 AHNAK-203ENST00000525875 793 ntTSL 310.45□□□□□ -0.742e-7■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.165e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.65e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 DDX5-218ENST00000581693 2156 ntTSL 510.56□□□□□ -0.725e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 DDX5-203ENST00000540698 2225 ntTSL 510.3□□□□□ -0.765e-8■□□□□ 10.4
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TRA2AQ13595 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.231e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 SF3B1-211ENST00000487698 2127 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -11e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.371e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.391e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.481e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 55.36□□□□□ -1.551e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.71e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 SF3B1-203ENST00000414174 593 ntTSL 43.72□□□□□ -1.811e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.611e-20■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.091e-20■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 UBB-207ENST00000578649 477 ntTSL 512.72□□□□□ -0.371e-20■□□□□ 10.4
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TRA2AQ13595 UBB-204ENST00000535788 704 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.971e-20■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 UBB-209ENST00000614404 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.991e-20■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 EIF3C-209ENST00000566501 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.672e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 EIF3C-204ENST00000564243 2870 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.712e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 EIF3C-202ENST00000395587 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 EIF3C-207ENST00000565932 3957 ntTSL 1 (best)8.04□□□□□ -1.122e-6■□□□□ 10.4
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TRA2AQ13595 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.915e-10■□□□□ 10.3
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TRA2AQ13595 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.234e-7■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.294e-7■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.114e-7■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.254e-7■□□□□ 10.3
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TRA2AQ13595 HNRNPK-209ENST00000483135 900 ntTSL 26.2□□□□□ -1.424e-7■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 FGL1-204ENST00000398056 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.758e-9■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.394e-7■□□□□ 10.3
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TRA2AQ13595 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.174e-7■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.074e-7■□□□□ 10.3
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TRA2AQ13595 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.264e-7■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 IARS-203ENST00000395554 1103 ntTSL 513.09□□□□□ -0.314e-23■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.354e-7■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 LONP1-206ENST00000587552 2816 ntTSL 212.81□□□□□ -0.364e-7■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 LONP1-209ENST00000590206 725 ntTSL 312.11□□□□□ -0.474e-7■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.294e-23■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.334e-23■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.454e-23■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.494e-23■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 IARS-204ENST00000430417 414 ntTSL 35.22□□□□□ -1.574e-23■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4□□□□□ -1.774e-23■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.38□□□□□ -1.874e-23■□□□□ 10.3
TRA2AQ13595 RPS24-212ENST00000482069 539 ntTSL 311□□□□□ -0.652e-29■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 RPS24-206ENST00000465692 778 ntTSL 210.32□□□□□ -0.762e-29■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 LUC7L3-204ENST00000503798 663 ntTSL 33.89□□□□□ -1.793e-10■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 LMO7-204ENST00000377499 3472 ntTSL 210.68□□□□□ -0.73e-6■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 LMO7-201ENST00000321797 5647 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -13e-6■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 LMO7-206ENST00000447038 3165 ntTSL 28.59□□□□□ -1.033e-6■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.223e-6■□□□□ 10.2
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