RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490438.1

IARS-211, Transcript of isoleucyl-tRNA synthetase, human

TSL 2

Gene IARS, Length 887 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IARS-211	ENST00000490438	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		36.52	■■■■□ 3.44
IARS-211	ENST00000490438	ABCC9	O60706	1549 aa		34.09	■■■■□ 3.05
IARS-211	ENST00000490438	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		33.26	■■■□□ 2.91
IARS-211	ENST00000490438	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.72	■■■□□ 2.83
IARS-211	ENST00000490438	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		32.08	■■■□□ 2.73
IARS-211	ENST00000490438	NACAD	O15069	1562 aa		31.62	■■■□□ 2.65
IARS-211	ENST00000490438	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	31.53	■■■□□ 2.64
IARS-211	ENST00000490438	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		31.36	■■■□□ 2.61
IARS-211	ENST00000490438	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		31.16	■■■□□ 2.58
IARS-211	ENST00000490438	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		31.14	■■■□□ 2.58
IARS-211	ENST00000490438	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		30.88	■■■□□ 2.53
IARS-211	ENST00000490438	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		30.82	■■■□□ 2.53
IARS-211	ENST00000490438	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		30.77	■■■□□ 2.52
IARS-211	ENST00000490438	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.77	■■■□□ 2.52
IARS-211	ENST00000490438	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		30.7	■■■□□ 2.51
IARS-211	ENST00000490438	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	30.49	■■■□□ 2.47
IARS-211	ENST00000490438	SCRIB	Q14160	1630 aa		30.21	■■■□□ 2.43
IARS-211	ENST00000490438	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		30.13	■■■□□ 2.41
IARS-211	ENST00000490438	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	30.09	■■■□□ 2.41
IARS-211	ENST00000490438	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	29.91	■■■□□ 2.38
IARS-211	ENST00000490438	CUX2	O14529	1486 aa		29.8	■■■□□ 2.36
IARS-211	ENST00000490438	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.54	■■■□□ 2.32
IARS-211	ENST00000490438	NCAPD3	P42695	1498 aa		29.17	■■■□□ 2.26
IARS-211	ENST00000490438	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.05	■■■□□ 2.24
IARS-211	ENST00000490438	NES	P48681	1621 aa		29.01	■■■□□ 2.23
IARS-211	ENST00000490438	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
IARS-211	ENST00000490438	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		28.95	■■■□□ 2.22
IARS-211	ENST00000490438	HMGXB3	Q12766	1538 aa		28.92	■■■□□ 2.22
IARS-211	ENST00000490438	SMARCA2	P51531	1590 aa		28.86	■■■□□ 2.21
IARS-211	ENST00000490438	SMARCA4	P51532	1647 aa		28.72	■■■□□ 2.19
IARS-211	ENST00000490438	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		28.71	■■■□□ 2.19
IARS-211	ENST00000490438	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		28.67	■■■□□ 2.18
IARS-211	ENST00000490438	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
IARS-211	ENST00000490438	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		28.54	■■■□□ 2.16
IARS-211	ENST00000490438	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		28.45	■■■□□ 2.14
IARS-211	ENST00000490438	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	28.44	■■■□□ 2.14
IARS-211	ENST00000490438	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		28.38	■■■□□ 2.13
IARS-211	ENST00000490438	WDR62	O43379	1518 aa		28.35	■■■□□ 2.13
IARS-211	ENST00000490438	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		28.22	■■■□□ 2.11
IARS-211	ENST00000490438	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.21	■■■□□ 2.11
IARS-211	ENST00000490438	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		28.11	■■■□□ 2.09
IARS-211	ENST00000490438	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		28.08	■■■□□ 2.09
IARS-211	ENST00000490438	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.03	■■■□□ 2.08
IARS-211	ENST00000490438	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.03	■■■□□ 2.08
IARS-211	ENST00000490438	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.03	■■■□□ 2.08
IARS-211	ENST00000490438	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		27.94	■■■□□ 2.06
IARS-211	ENST00000490438	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		27.86	■■■□□ 2.05
IARS-211	ENST00000490438	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.83	■■■□□ 2.05
IARS-211	ENST00000490438	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
IARS-211	ENST00000490438	WIZ	O95785	1651 aa		27.75	■■■□□ 2.03
IARS-211	ENST00000490438	CFTR	P13569	1480 aa		27.72	■■■□□ 2.03
IARS-211	ENST00000490438	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
IARS-211	ENST00000490438	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.6	■■■□□ 2.01
IARS-211	ENST00000490438	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
IARS-211	ENST00000490438	IFT140	Q96RY7	1462 aa		27.54	■■■□□ 2
IARS-211	ENST00000490438	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.49	■■□□□ 1.99
IARS-211	ENST00000490438	PRDM2	Q13029	1718 aa		27.46	■■□□□ 1.99
IARS-211	ENST00000490438	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	27.43	■■□□□ 1.98
IARS-211	ENST00000490438	CHD1	O14646	1710 aa		27.4	■■□□□ 1.98
IARS-211	ENST00000490438	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	27.36	■■□□□ 1.97
IARS-211	ENST00000490438	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	27.35	■■□□□ 1.97
IARS-211	ENST00000490438	TOPBP1	Q92547	1522 aa		27.31	■■□□□ 1.96
IARS-211	ENST00000490438	ABCC8	Q09428	1581 aa		27.19	■■□□□ 1.94
IARS-211	ENST00000490438	FBLN2	P98095	1184 aa		27.17	■■□□□ 1.94
IARS-211	ENST00000490438	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	27.17	■■□□□ 1.94	1e-6	■■■□□ 15.5
IARS-211	ENST00000490438	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		27.15	■■□□□ 1.94
IARS-211	ENST00000490438	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	27.15	■■□□□ 1.94
IARS-211	ENST00000490438	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.05	■■□□□ 1.92
IARS-211	ENST00000490438	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		27	■■□□□ 1.91
IARS-211	ENST00000490438	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	26.96	■■□□□ 1.91
IARS-211	ENST00000490438	SYNJ1	O43426	1573 aa		26.95	■■□□□ 1.9
IARS-211	ENST00000490438	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		26.92	■■□□□ 1.9
IARS-211	ENST00000490438	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	26.85	■■□□□ 1.89
IARS-211	ENST00000490438	WDR97	A6NE52	1622 aa		26.85	■■□□□ 1.89
IARS-211	ENST00000490438	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		26.85	■■□□□ 1.89
IARS-211	ENST00000490438	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	26.82	■■□□□ 1.88
IARS-211	ENST00000490438	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	26.81	■■□□□ 1.88
IARS-211	ENST00000490438	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		26.81	■■□□□ 1.88
IARS-211	ENST00000490438	SOGA1	O94964	1423 aa		26.79	■■□□□ 1.88
IARS-211	ENST00000490438	SYNJ2	O15056	1496 aa		26.74	■■□□□ 1.87
IARS-211	ENST00000490438	GRIN2B	Q13224	1484 aa		26.7	■■□□□ 1.87
IARS-211	ENST00000490438	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		26.67	■■□□□ 1.86
IARS-211	ENST00000490438	PBRM1	Q86U86	1689 aa		26.59	■■□□□ 1.85
IARS-211	ENST00000490438	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		26.52	■■□□□ 1.84
IARS-211	ENST00000490438	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		26.51	■■□□□ 1.83
IARS-211	ENST00000490438	CUX1	P39880	1505 aa		26.49	■■□□□ 1.83
IARS-211	ENST00000490438	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	26.43	■■□□□ 1.82
IARS-211	ENST00000490438	CEP170	Q5SW79	1584 aa		26.41	■■□□□ 1.82
IARS-211	ENST00000490438	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		26.39	■■□□□ 1.81
IARS-211	ENST00000490438	GRIN2A	Q12879	1464 aa		26.37	■■□□□ 1.81
IARS-211	ENST00000490438	SHROOM2	Q13796	1616 aa		26.32	■■□□□ 1.8
IARS-211	ENST00000490438	NUP160	Q12769	1436 aa		26.31	■■□□□ 1.8
IARS-211	ENST00000490438	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		26.3	■■□□□ 1.8
IARS-211	ENST00000490438	ADAMTS12	P58397	1594 aa		26.27	■■□□□ 1.8
IARS-211	ENST00000490438	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		26.24	■■□□□ 1.79
IARS-211	ENST00000490438	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		26.21	■■□□□ 1.79
IARS-211	ENST00000490438	KDM6B	O15054	1643 aa		26.18	■■□□□ 1.78
IARS-211	ENST00000490438	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		26.18	■■□□□ 1.78
IARS-211	ENST00000490438	DIP2B	Q9P265	1576 aa		26.16	■■□□□ 1.78
IARS-211	ENST00000490438	MAPKBP1	O60336	1514 aa		26.14	■■□□□ 1.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms