RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590558.5

LONP1-211, Transcript of lon peptidase 1, mitochondrial, humanhuman

TSL 5

Gene LONP1, Length 2,884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONP1-211ENST00000590558 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.52■■■■□ 3.92
LONP1-211ENST00000590558 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.34■■■■□ 3.09
LONP1-211ENST00000590558 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.26■■■□□ 2.92
LONP1-211ENST00000590558 ABCC9O60706 1549 aa33.2■■■□□ 2.91
LONP1-211ENST00000590558 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
LONP1-211ENST00000590558 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.51■■■□□ 2.79
LONP1-211ENST00000590558 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.46■■■□□ 2.79
LONP1-211ENST00000590558 NACADO15069 1562 aa32.16■■■□□ 2.74
LONP1-211ENST00000590558 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.13■■■□□ 2.73
LONP1-211ENST00000590558 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.99■■■□□ 2.71
LONP1-211ENST00000590558 SCRIBQ14160 1630 aa31.9■■■□□ 2.7
LONP1-211ENST00000590558 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.41■■■□□ 2.621e-7■■□□□ 11.8
LONP1-211ENST00000590558 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.33■■■□□ 2.61
LONP1-211ENST00000590558 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
LONP1-211ENST00000590558 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.1■■■□□ 2.57
LONP1-211ENST00000590558 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.91■■■□□ 2.54
LONP1-211ENST00000590558 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
LONP1-211ENST00000590558 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.63■■■□□ 2.49
LONP1-211ENST00000590558 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
LONP1-211ENST00000590558 SMARCA4P51532 1647 aa30.41■■■□□ 2.46
LONP1-211ENST00000590558 WIZO95785 1651 aa30.34■■■□□ 2.45
LONP1-211ENST00000590558 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
LONP1-211ENST00000590558 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.05■■■□□ 2.4
LONP1-211ENST00000590558 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.92■■■□□ 2.38
LONP1-211ENST00000590558 SMARCA2P51531 1590 aa29.91■■■□□ 2.38
LONP1-211ENST00000590558 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
LONP1-211ENST00000590558 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.37
LONP1-211ENST00000590558 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.86■■■□□ 2.37
LONP1-211ENST00000590558 NCAPD3P42695 1498 aa29.77■■■□□ 2.36
LONP1-211ENST00000590558 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.73■■■□□ 2.35
LONP1-211ENST00000590558 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.66■■■□□ 2.34
LONP1-211ENST00000590558 HMGXB3Q12766 1538 aa29.61■■■□□ 2.33
LONP1-211ENST00000590558 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.49■■■□□ 2.31
LONP1-211ENST00000590558 TRIM41Q8WV44 630 aa29.16■■■□□ 2.26
LONP1-211ENST00000590558 ABCC8Q09428 1581 aa29.1■■■□□ 2.25
LONP1-211ENST00000590558 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.09■■■□□ 2.25
LONP1-211ENST00000590558 CFTRP13569 1480 aa29.07■■■□□ 2.24
LONP1-211ENST00000590558 NESP48681 1621 aa29.05■■■□□ 2.24
LONP1-211ENST00000590558 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
LONP1-211ENST00000590558 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
LONP1-211ENST00000590558 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.77■■■□□ 2.2
LONP1-211ENST00000590558 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.74■■■□□ 2.19
LONP1-211ENST00000590558 SYNJ1O43426 1573 aa28.73■■■□□ 2.19
LONP1-211ENST00000590558 PRDM2Q13029 1718 aa28.65■■■□□ 2.18
LONP1-211ENST00000590558 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.64■■■□□ 2.18
LONP1-211ENST00000590558 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.62■■■□□ 2.17
LONP1-211ENST00000590558 CUX1P39880 1505 aa28.62■■■□□ 2.17
LONP1-211ENST00000590558 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.58■■■□□ 2.17
LONP1-211ENST00000590558 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.54■■■□□ 2.16
LONP1-211ENST00000590558 SOGA1O94964 1423 aa28.53■■■□□ 2.16
LONP1-211ENST00000590558 TOP2BQ02880 1626 aa28.52■■■□□ 2.16
LONP1-211ENST00000590558 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.5■■■□□ 2.15
LONP1-211ENST00000590558 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.46■■■□□ 2.15
LONP1-211ENST00000590558 ERCC6Q03468 1493 aa28.44■■■□□ 2.14
LONP1-211ENST00000590558 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
LONP1-211ENST00000590558 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.42■■■□□ 2.14
LONP1-211ENST00000590558 TOPBP1Q92547 1522 aa28.4■■■□□ 2.14
LONP1-211ENST00000590558 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.38■■■□□ 2.13
LONP1-211ENST00000590558 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.34■■■□□ 2.13
LONP1-211ENST00000590558 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.29■■■□□ 2.12
LONP1-211ENST00000590558 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
LONP1-211ENST00000590558 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.27■■■□□ 2.12
LONP1-211ENST00000590558 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.26■■■□□ 2.11
LONP1-211ENST00000590558 CUX2O14529 1486 aa28.2■■■□□ 2.1
LONP1-211ENST00000590558 KIF27Q86VH2 1401 aa28.13■■■□□ 2.09
LONP1-211ENST00000590558 EEA1Q15075 1411 aa28.12■■■□□ 2.09
LONP1-211ENST00000590558 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
LONP1-211ENST00000590558 WDR62O43379 1518 aa28.06■■■□□ 2.08
LONP1-211ENST00000590558 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
LONP1-211ENST00000590558 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
LONP1-211ENST00000590558 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.02■■■□□ 2.08
LONP1-211ENST00000590558 IGF1RP08069 1367 aa27.97■■■□□ 2.07
LONP1-211ENST00000590558 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.062e-7■■■□□ 19
LONP1-211ENST00000590558 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
LONP1-211ENST00000590558 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.91■■■□□ 2.06
LONP1-211ENST00000590558 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
LONP1-211ENST00000590558 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
LONP1-211ENST00000590558 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.87■■■□□ 2.05
LONP1-211ENST00000590558 IFT140Q96RY7 1462 aa27.86■■■□□ 2.05
LONP1-211ENST00000590558 GOLGA3Q08378 1498 aa27.85■■■□□ 2.05
LONP1-211ENST00000590558 WDR97A6NE52 1622 aa27.83■■■□□ 2.05
LONP1-211ENST00000590558 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.83■■■□□ 2.05
LONP1-211ENST00000590558 PRXQ9BXM0 1461 aa27.83■■■□□ 2.05
LONP1-211ENST00000590558 KIF21BO75037 1637 aa27.77■■■□□ 2.04
LONP1-211ENST00000590558 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.76■■■□□ 2.04
LONP1-211ENST00000590558 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.72■■■□□ 2.03
LONP1-211ENST00000590558 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
LONP1-211ENST00000590558 CEP162Q5TB80 1403 aa27.64■■■□□ 2.01
LONP1-211ENST00000590558 GRIN2BQ13224 1484 aa27.64■■■□□ 2.01
LONP1-211ENST00000590558 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.63■■■□□ 2.01
LONP1-211ENST00000590558 FBLN2P98095 1184 aa27.6■■■□□ 2.01
LONP1-211ENST00000590558 PBRM1Q86U86 1689 aa27.57■■■□□ 2
LONP1-211ENST00000590558 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.56■■■□□ 2
LONP1-211ENST00000590558 CUL7Q14999 1698 aa27.54■■■□□ 2
LONP1-211ENST00000590558 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.51■■□□□ 1.99
LONP1-211ENST00000590558 CLIP1P30622 1438 aa27.49■■□□□ 1.99
LONP1-211ENST00000590558 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
LONP1-211ENST00000590558 ADAMTS12P58397 1594 aa27.45■■□□□ 1.98
LONP1-211ENST00000590558 P3H3Q8IVL6 736 aa27.42■■□□□ 1.98
LONP1-211ENST00000590558 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms