Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDGFL3Q9Y3E1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDGFL3Q9Y3E1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDGFL3Q9Y3E1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDGFL3Q9Y3E1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HDGFL3Q9Y3E1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDGFL3Q9Y3E1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDGFL3Q9Y3E1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL3Q9Y3E1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDGFL3Q9Y3E1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms