Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNX4

WDR3, WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR3Q9UNX4 TTN-AS1-241ENST00000591332 528 ntTSL 55.73□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TTN-AS1-266ENST00000628296 483 ntTSL 55.64□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 DCUN1D1-206ENST00000492563 659 ntTSL 55.63□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.742e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.742e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.792e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 RPGR-209ENST00000494707 426 ntTSL 53.69□□□□□ -1.822e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.842e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.862e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.526e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.356e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.246e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.246e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 PPFIBP1-213ENST00000541633 574 ntTSL 422.37■■□□□ 1.176e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 FZR1-207ENST00000591290 1331 ntTSL 520.82■□□□□ 0.926e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.926e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.846e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.766e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.756e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.696e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.616e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TOM1-205ENST00000424387 2211 ntTSL 518.8■□□□□ 0.66e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.56e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.436e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.426e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.426e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 FZR1-208ENST00000592214 598 ntTSL 316.92■□□□□ 0.36e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.286e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.276e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 LRRC37A3-207ENST00000580439 513 ntTSL 316.73■□□□□ 0.276e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.266e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TOM1-203ENST00000404284 2622 ntTSL 216.64■□□□□ 0.256e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.256e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.146e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.116e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 RNF4-213ENST00000509388 569 ntTSL 315.71■□□□□ 0.116e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 ZNF687-205ENST00000443959 893 ntTSL 1 (best)15.7■□□□□ 0.16e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.096e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 PPFIBP1-210ENST00000540114 2645 ntTSL 215.62■□□□□ 0.096e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.026e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.026e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 RNF4-208ENST00000507247 616 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 06e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 RNF4-202ENST00000502316 855 ntTSL 215.01□□□□□ -0.016e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 RILPL1-201ENST00000340724 2389 ntTSL 514.98□□□□□ -0.016e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.026e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.156e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 RNF4-215ENST00000511843 586 ntTSL 513.96□□□□□ -0.176e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 WDTC1-203ENST00000447062 3115 ntTSL 213.94□□□□□ -0.186e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.226e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 MACF1-230ENST00000530275 5767 nt13.59□□□□□ -0.236e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 MROH1-205ENST00000527552 5832 ntTSL 1 (best)13.48□□□□□ -0.256e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 WDTC1-205ENST00000491239 5149 ntTSL 213.39□□□□□ -0.276e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TRAPPC12-206ENST00000417243 1047 ntTSL 513.33□□□□□ -0.286e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TRAPPC12-217ENST00000473348 491 ntTSL 513.32□□□□□ -0.286e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 RNF4-201ENST00000314289 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.326e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TRAPPC12-207ENST00000433382 578 ntTSL 513.05□□□□□ -0.326e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 RNF4-222ENST00000541204 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.326e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 MROH1-211ENST00000544576 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.356e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 MACF1-235ENST00000641104 5460 nt12.38□□□□□ -0.436e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 DUXAP10-206ENST00000614614 712 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.446e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.446e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TRAPPC12-223ENST00000497597 3401 ntTSL 211.99□□□□□ -0.496e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 RNF4-218ENST00000513284 517 ntTSL 411.95□□□□□ -0.56e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TRAPPC12-205ENST00000416918 473 ntTSL 311.69□□□□□ -0.546e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TRAPPC12-204ENST00000415624 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.61□□□□□ -0.556e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 RNF4-212ENST00000509258 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.586e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 MACF1-234ENST00000641012 4284 ntBASIC11.27□□□□□ -0.616e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TRAPPC12-213ENST00000461577 677 ntTSL 211.15□□□□□ -0.626e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 LRRC37A3-201ENST00000319651 5537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.666e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 LRRC37A3-211ENST00000584306 5665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.76e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 PPFIBP1-217ENST00000545381 1191 ntTSL 1 (best)10.44□□□□□ -0.746e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 RNF4-221ENST00000513643 516 ntTSL 310.24□□□□□ -0.776e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 PPFIBP1-207ENST00000537927 5719 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.846e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TRAPPC12-221ENST00000489032 561 ntTSL 39.08□□□□□ -0.966e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.086e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.166e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 LRRC37A3-209ENST00000581368 735 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.48□□□□□ -1.216e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 TRAPPC12-208ENST00000437733 518 ntTSL 57.19□□□□□ -1.266e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.276e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.286e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.366e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.366e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 MACF1-205ENST00000372925 14496 ntTSL 56.03□□□□□ -1.446e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.66e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.676e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.716e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 PPFIBP1-208ENST00000538433 609 ntTSL 34.09□□□□□ -1.756e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.796e-6■■■■■ 55.1
WDR3Q9UNX4 GATA2-206ENST00000498200 563 ntTSL 219.26■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 49.4
WDR3Q9UNX4 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 49.4
WDR3Q9UNX4 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 48
WDR3Q9UNX4 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 414.13□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 48
WDR3Q9UNX4 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 48
WDR3Q9UNX4 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 48
WDR3Q9UNX4 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 48
WDR3Q9UNX4 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 28.13□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 48
Retrieved 100 of 1,750 protein–RNA pairs in 235.4 ms