Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKP3

ITGB1BP2, Integrin beta-1-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1BP2Q9UKP3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB1BP2Q9UKP3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB1BP2Q9UKP3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB1BP2Q9UKP3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB1BP2Q9UKP3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB1BP2Q9UKP3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB1BP2Q9UKP3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB1BP2Q9UKP3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB1BP2Q9UKP3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB1BP2Q9UKP3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB1BP2Q9UKP3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB1BP2Q9UKP3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB1BP2Q9UKP3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB1BP2Q9UKP3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB1BP2Q9UKP3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB1BP2Q9UKP3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB1BP2Q9UKP3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB1BP2Q9UKP3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB1BP2Q9UKP3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB1BP2Q9UKP3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB1BP2Q9UKP3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms