Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF7Q9UBF6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF7Q9UBF6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF7Q9UBF6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF7Q9UBF6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.9 ms