Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHOXF2Q9BQY4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RHOXF2Q9BQY4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RHOXF2Q9BQY4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RHOXF2Q9BQY4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RHOXF2Q9BQY4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RHOXF2Q9BQY4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RHOXF2Q9BQY4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RHOXF2Q9BQY4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RHOXF2Q9BQY4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOXF2Q9BQY4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOXF2Q9BQY4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHOXF2Q9BQY4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOXF2Q9BQY4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOXF2Q9BQY4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOXF2Q9BQY4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHOXF2Q9BQY4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHOXF2Q9BQY4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOXF2Q9BQY4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOXF2Q9BQY4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RHOXF2Q9BQY4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RHOXF2Q9BQY4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RHOXF2Q9BQY4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHOXF2Q9BQY4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHOXF2Q9BQY4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOXF2Q9BQY4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOXF2Q9BQY4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHOXF2Q9BQY4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHOXF2Q9BQY4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RHOXF2Q9BQY4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RHOXF2Q9BQY4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RHOXF2Q9BQY4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RHOXF2Q9BQY4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RHOXF2Q9BQY4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RHOXF2Q9BQY4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RHOXF2Q9BQY4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOXF2Q9BQY4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOXF2Q9BQY4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RHOXF2Q9BQY4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms