Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COPS8Q99627 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPS8Q99627 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPS8Q99627 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPS8Q99627 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPS8Q99627 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPS8Q99627 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPS8Q99627 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPS8Q99627 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPS8Q99627 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPS8Q99627 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPS8Q99627 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPS8Q99627 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPS8Q99627 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPS8Q99627 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COPS8Q99627 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COPS8Q99627 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COPS8Q99627 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPS8Q99627 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPS8Q99627 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPS8Q99627 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPS8Q99627 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPS8Q99627 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPS8Q99627 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPS8Q99627 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPS8Q99627 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPS8Q99627 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COPS8Q99627 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPS8Q99627 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPS8Q99627 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPS8Q99627 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPS8Q99627 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPS8Q99627 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
COPS8Q99627 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPS8Q99627 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPS8Q99627 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
COPS8Q99627 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPS8Q99627 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPS8Q99627 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPS8Q99627 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms