Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL13Q99616 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL13Q99616 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL13Q99616 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL13Q99616 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175 ms