Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALPK3Q96L96 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALPK3Q96L96 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALPK3Q96L96 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALPK3Q96L96 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALPK3Q96L96 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALPK3Q96L96 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALPK3Q96L96 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALPK3Q96L96 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALPK3Q96L96 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ALPK3Q96L96 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ALPK3Q96L96 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ALPK3Q96L96 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALPK3Q96L96 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALPK3Q96L96 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALPK3Q96L96 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALPK3Q96L96 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALPK3Q96L96 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALPK3Q96L96 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALPK3Q96L96 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALPK3Q96L96 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALPK3Q96L96 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALPK3Q96L96 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ALPK3Q96L96 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALPK3Q96L96 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALPK3Q96L96 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALPK3Q96L96 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALPK3Q96L96 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALPK3Q96L96 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALPK3Q96L96 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALPK3Q96L96 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALPK3Q96L96 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALPK3Q96L96 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALPK3Q96L96 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALPK3Q96L96 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALPK3Q96L96 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALPK3Q96L96 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALPK3Q96L96 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALPK3Q96L96 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALPK3Q96L96 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALPK3Q96L96 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ALPK3Q96L96 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALPK3Q96L96 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALPK3Q96L96 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ALPK3Q96L96 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALPK3Q96L96 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALPK3Q96L96 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALPK3Q96L96 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALPK3Q96L96 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALPK3Q96L96 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALPK3Q96L96 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALPK3Q96L96 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALPK3Q96L96 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALPK3Q96L96 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALPK3Q96L96 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALPK3Q96L96 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALPK3Q96L96 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALPK3Q96L96 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALPK3Q96L96 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALPK3Q96L96 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALPK3Q96L96 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALPK3Q96L96 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALPK3Q96L96 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALPK3Q96L96 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALPK3Q96L96 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALPK3Q96L96 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ALPK3Q96L96 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALPK3Q96L96 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms