Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC52.45■■■■■ 5.99
RB1CC1Q8TDY2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
RB1CC1Q8TDY2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
RB1CC1Q8TDY2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC52.39■■■■■ 5.98
RB1CC1Q8TDY2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.38■■■■■ 5.98
RB1CC1Q8TDY2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.38■■■■■ 5.98
RB1CC1Q8TDY2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
RB1CC1Q8TDY2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC52.35■■■■■ 5.97
RB1CC1Q8TDY2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC52.34■■■■■ 5.97
RB1CC1Q8TDY2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
RB1CC1Q8TDY2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC52.34■■■■■ 5.97
RB1CC1Q8TDY2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
RB1CC1Q8TDY2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
RB1CC1Q8TDY2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC52.33■■■■■ 5.97
RB1CC1Q8TDY2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC52.32■■■■■ 5.97
RB1CC1Q8TDY2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
RB1CC1Q8TDY2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC52.29■■■■■ 5.96
RB1CC1Q8TDY2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC52.29■■■■■ 5.96
RB1CC1Q8TDY2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC52.28■■■■■ 5.96
RB1CC1Q8TDY2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
RB1CC1Q8TDY2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.21■■■■■ 5.95
RB1CC1Q8TDY2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC52.21■■■■■ 5.95
RB1CC1Q8TDY2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.16■■■■■ 5.94
RB1CC1Q8TDY2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC52.15■■■■■ 5.94
RB1CC1Q8TDY2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.14■■■■■ 5.94
RB1CC1Q8TDY2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC52.13■■■■■ 5.94
RB1CC1Q8TDY2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC52.13■■■■■ 5.93
RB1CC1Q8TDY2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC52.12■■■■■ 5.93
RB1CC1Q8TDY2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.11■■■■■ 5.93
RB1CC1Q8TDY2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.1■■■■■ 5.93
RB1CC1Q8TDY2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC52.09■■■■■ 5.93
RB1CC1Q8TDY2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC52.09■■■■■ 5.93
RB1CC1Q8TDY2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC52.08■■■■■ 5.93
RB1CC1Q8TDY2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC52.07■■■■■ 5.93
RB1CC1Q8TDY2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.07■■■■■ 5.93
RB1CC1Q8TDY2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC52.06■■■■■ 5.93
RB1CC1Q8TDY2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.06■■■■■ 5.92
RB1CC1Q8TDY2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC52.05■■■■■ 5.92
RB1CC1Q8TDY2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.05■■■■■ 5.92
RB1CC1Q8TDY2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.05■■■■■ 5.92
RB1CC1Q8TDY2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
RB1CC1Q8TDY2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
RB1CC1Q8TDY2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC52.01■■■■■ 5.92
RB1CC1Q8TDY2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52■■■■■ 5.92
RB1CC1Q8TDY2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC52■■■■■ 5.91
RB1CC1Q8TDY2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC51.99■■■■■ 5.91
RB1CC1Q8TDY2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
RB1CC1Q8TDY2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC51.98■■■■■ 5.91
RB1CC1Q8TDY2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.97■■■■■ 5.91
RB1CC1Q8TDY2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC51.97■■■■■ 5.91
RB1CC1Q8TDY2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.96■■■■■ 5.91
RB1CC1Q8TDY2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.95■■■■■ 5.91
RB1CC1Q8TDY2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC51.95■■■■■ 5.91
RB1CC1Q8TDY2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC51.94■■■■■ 5.91
RB1CC1Q8TDY2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC51.93■■■■■ 5.9
RB1CC1Q8TDY2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC51.93■■■■■ 5.9
RB1CC1Q8TDY2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC51.91■■■■■ 5.9
RB1CC1Q8TDY2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC51.9■■■■■ 5.9
RB1CC1Q8TDY2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC51.89■■■■■ 5.9
RB1CC1Q8TDY2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC51.88■■■■■ 5.9
RB1CC1Q8TDY2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC51.88■■■■■ 5.9
RB1CC1Q8TDY2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.87■■■■■ 5.89
RB1CC1Q8TDY2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC51.86■■■■■ 5.89
RB1CC1Q8TDY2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.85■■■■■ 5.89
RB1CC1Q8TDY2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC51.85■■■■■ 5.89
RB1CC1Q8TDY2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.83■■■■■ 5.89
RB1CC1Q8TDY2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.83■■■■■ 5.89
RB1CC1Q8TDY2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.81■■■■■ 5.88
RB1CC1Q8TDY2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.8■■■■■ 5.88
RB1CC1Q8TDY2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC51.79■■■■■ 5.88
RB1CC1Q8TDY2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
RB1CC1Q8TDY2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC51.78■■■■■ 5.88
RB1CC1Q8TDY2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC51.77■■■■■ 5.88
RB1CC1Q8TDY2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.76■■■■■ 5.88
RB1CC1Q8TDY2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC51.76■■■■■ 5.88
RB1CC1Q8TDY2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC51.76■■■■■ 5.88
RB1CC1Q8TDY2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.88
RB1CC1Q8TDY2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.87
RB1CC1Q8TDY2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.87
RB1CC1Q8TDY2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.87
RB1CC1Q8TDY2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.73■■■■■ 5.87
RB1CC1Q8TDY2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
RB1CC1Q8TDY2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC51.73■■■■■ 5.87
RB1CC1Q8TDY2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
RB1CC1Q8TDY2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
RB1CC1Q8TDY2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.86
RB1CC1Q8TDY2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.63■■■■■ 5.86
RB1CC1Q8TDY2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC51.63■■■■■ 5.86
RB1CC1Q8TDY2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC51.62■■■■■ 5.85
RB1CC1Q8TDY2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
RB1CC1Q8TDY2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
RB1CC1Q8TDY2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC51.61■■■■■ 5.85
RB1CC1Q8TDY2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC51.61■■■■■ 5.85
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC51.6■■■■■ 5.85
RB1CC1Q8TDY2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC51.59■■■■■ 5.85
RB1CC1Q8TDY2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC51.59■■■■■ 5.85
RB1CC1Q8TDY2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC51.58■■■■■ 5.85
RB1CC1Q8TDY2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC51.58■■■■■ 5.85
RB1CC1Q8TDY2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.57■■■■■ 5.85
RB1CC1Q8TDY2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.57■■■■■ 5.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms