Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI29

FBXO27, F-box only protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO27Q8NI29 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO27Q8NI29 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO27Q8NI29 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO27Q8NI29 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO27Q8NI29 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO27Q8NI29 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO27Q8NI29 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO27Q8NI29 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO27Q8NI29 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO27Q8NI29 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO27Q8NI29 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO27Q8NI29 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO27Q8NI29 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO27Q8NI29 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO27Q8NI29 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO27Q8NI29 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO27Q8NI29 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO27Q8NI29 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO27Q8NI29 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO27Q8NI29 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO27Q8NI29 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO27Q8NI29 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO27Q8NI29 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO27Q8NI29 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO27Q8NI29 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO27Q8NI29 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO27Q8NI29 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO27Q8NI29 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO27Q8NI29 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms