Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCE3

PGM2L1, Glucose 1,6-bisphosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM2L1Q6PCE3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGM2L1Q6PCE3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGM2L1Q6PCE3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGM2L1Q6PCE3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGM2L1Q6PCE3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGM2L1Q6PCE3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGM2L1Q6PCE3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGM2L1Q6PCE3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGM2L1Q6PCE3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGM2L1Q6PCE3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGM2L1Q6PCE3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGM2L1Q6PCE3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PGM2L1Q6PCE3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PGM2L1Q6PCE3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGM2L1Q6PCE3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGM2L1Q6PCE3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGM2L1Q6PCE3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGM2L1Q6PCE3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGM2L1Q6PCE3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGM2L1Q6PCE3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGM2L1Q6PCE3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGM2L1Q6PCE3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGM2L1Q6PCE3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGM2L1Q6PCE3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGM2L1Q6PCE3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGM2L1Q6PCE3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM2L1Q6PCE3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGM2L1Q6PCE3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGM2L1Q6PCE3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGM2L1Q6PCE3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGM2L1Q6PCE3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGM2L1Q6PCE3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGM2L1Q6PCE3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGM2L1Q6PCE3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGM2L1Q6PCE3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGM2L1Q6PCE3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGM2L1Q6PCE3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGM2L1Q6PCE3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGM2L1Q6PCE3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PGM2L1Q6PCE3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PGM2L1Q6PCE3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGM2L1Q6PCE3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGM2L1Q6PCE3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGM2L1Q6PCE3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PGM2L1Q6PCE3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGM2L1Q6PCE3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGM2L1Q6PCE3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGM2L1Q6PCE3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGM2L1Q6PCE3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGM2L1Q6PCE3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGM2L1Q6PCE3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGM2L1Q6PCE3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGM2L1Q6PCE3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGM2L1Q6PCE3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGM2L1Q6PCE3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGM2L1Q6PCE3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms