Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.616e-9■■■■■ 51
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PCBP1Q15365 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.992e-6■■■■■ 50.9
PCBP1Q15365 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.892e-6■■■■■ 50.9
PCBP1Q15365 MFSD12-207ENST00000588626 525 ntTSL 319.67■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 50.9
PCBP1Q15365 MFSD12-212ENST00000591878 557 ntTSL 517.83■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 50.9
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PCBP1Q15365 MFSD12-213ENST00000592652 486 ntTSL 515.33■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 50.9
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PCBP1Q15365 CDC14B-209ENST00000474602 4960 ntTSL 1 (best)22.63■■□□□ 1.219e-10■■■■■ 50.5
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PCBP1Q15365 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.769e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.659e-10■■■■■ 50.5
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PCBP1Q15365 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.319e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 NDRG1-211ENST00000519228 729 ntTSL 416.78■□□□□ 0.289e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.279e-10■■■■■ 50.5
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PCBP1Q15365 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.139e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 NDRG1-214ENST00000520230 582 ntTSL 414.92□□□□□ -0.029e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 NDRG1-206ENST00000518010 581 ntTSL 414.73□□□□□ -0.059e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 PLD3-212ENST00000486134 327 ntTSL 214.69□□□□□ -0.062e-15■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.099e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 NDRG1-213ENST00000519580 550 ntTSL 514.44□□□□□ -0.19e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.149e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 NDRG1-221ENST00000522377 1103 ntTSL 513.87□□□□□ -0.199e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 FOXRED2-202ENST00000366463 2489 ntTSL 212.84□□□□□ -0.359e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 CDC14B-204ENST00000412285 5271 ntTSL 1 (best)9.45□□□□□ -0.99e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.769e-10■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.362e-9■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-9■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 CABLES1-210ENST00000585061 584 ntTSL 514.51□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 CABLES1-205ENST00000579963 2074 ntTSL 211.29□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 50.5
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PCBP1Q15365 CABLES1-202ENST00000400473 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 50.5
PCBP1Q15365 CELSR2-204ENST00000498157 3680 ntTSL 212.4□□□□□ -0.431e-10■■■■■ 50.2
PCBP1Q15365 CELSR2-203ENST00000489018 2958 ntTSL 512.18□□□□□ -0.461e-10■■■■■ 50.2
PCBP1Q15365 CELSR2-201ENST00000271332 10534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.511e-10■■■■■ 50.2
PCBP1Q15365 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.465e-8■■■■■ 50
PCBP1Q15365 ERI3-204ENST00000456170 1103 ntTSL 514.51□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 50
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PCBP1Q15365 FMC1-202ENST00000468383 345 ntTSL 316.16■□□□□ 0.181e-22■■■■■ 50
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PCBP1Q15365 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 49.8
PCBP1Q15365 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 49.8
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PCBP1Q15365 APOC1-206ENST00000590334 508 ntTSL 513.31□□□□□ -0.285e-16■■■■■ 49.4
PCBP1Q15365 APOC1-203ENST00000588802 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.625e-16■■■■■ 49.4
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PCBP1Q15365 CTDNEP1-206ENST00000571409 741 ntTSL 533.71■■■□□ 2.993e-14■■■■■ 49.4
PCBP1Q15365 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.397e-11■■■■■ 49.4
PCBP1Q15365 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.747e-11■■■■■ 49.4
PCBP1Q15365 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.73e-14■■■■■ 49.4
PCBP1Q15365 CTDNEP1-211ENST00000575783 876 ntTSL 518.09■□□□□ 0.493e-14■■■■■ 49.4
PCBP1Q15365 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.651e-9■■■■■ 49.3
PCBP1Q15365 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 519.46■□□□□ 0.711e-9■■■■■ 49.3
PCBP1Q15365 NLGN2-203ENST00000572893 305 ntTSL 327.3■■□□□ 1.964e-8■■■■■ 49.2
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PCBP1Q15365 PPP2R5E-207ENST00000556878 3371 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 49.2
PCBP1Q15365 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 510.4□□□□□ -0.747e-11■■■■■ 49.2
PCBP1Q15365 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 57.59□□□□□ -1.197e-11■■■■■ 49.2
PCBP1Q15365 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 54.62□□□□□ -1.677e-11■■■■■ 49.2
PCBP1Q15365 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 54.4□□□□□ -1.77e-11■■■■■ 49.2
PCBP1Q15365 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.117e-11■■■■■ 49.2
PCBP1Q15365 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 49.1
PCBP1Q15365 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -12e-7■■■■■ 49.1
PCBP1Q15365 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.17e-9■■■■■ 49
PCBP1Q15365 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.947e-9■■■■■ 49
PCBP1Q15365 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.887e-9■■■■■ 49
PCBP1Q15365 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.847e-9■■■■■ 49
PCBP1Q15365 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.467e-9■■■■■ 49
PCBP1Q15365 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.039e-7■■■■■ 49
PCBP1Q15365 ABCC6-202ENST00000456970 4137 ntTSL 214.25□□□□□ -0.139e-7■■■■■ 49
PCBP1Q15365 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.189e-7■■■■■ 49
PCBP1Q15365 FARP2-219ENST00000486736 578 ntTSL 314.59□□□□□ -0.073e-8■■■■■ 48.7
PCBP1Q15365 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 48.7
PCBP1Q15365 FARP2-220ENST00000491425 484 ntTSL 313.18□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 48.7
PCBP1Q15365 U2AF2-203ENST00000587196 778 ntTSL 315.82■□□□□ 0.129e-10■■■■■ 48.7
PCBP1Q15365 PXN-203ENST00000323871 5457 ntTSL 218.4■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 48.6
PCBP1Q15365 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 48.6
PCBP1Q15365 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 48.6
PCBP1Q15365 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.471e-8■■■■■ 48.6
PCBP1Q15365 PXN-206ENST00000458477 3807 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.711e-8■■■■■ 48.6
PCBP1Q15365 PXN-202ENST00000267257 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.711e-8■■■■■ 48.6
PCBP1Q15365 AC018552.2-201ENST00000563062 804 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 48.6
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