Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5R2Q13319 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5R2Q13319 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5R2Q13319 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5R2Q13319 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5R2Q13319 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5R2Q13319 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5R2Q13319 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5R2Q13319 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5R2Q13319 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5R2Q13319 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5R2Q13319 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5R2Q13319 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5R2Q13319 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK5R2Q13319 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5R2Q13319 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK5R2Q13319 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5R2Q13319 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5R2Q13319 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5R2Q13319 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK5R2Q13319 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK5R2Q13319 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5R2Q13319 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5R2Q13319 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5R2Q13319 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5R2Q13319 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5R2Q13319 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5R2Q13319 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms