Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXF1Q12946 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXF1Q12946 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXF1Q12946 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXF1Q12946 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXF1Q12946 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXF1Q12946 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXF1Q12946 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXF1Q12946 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXF1Q12946 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXF1Q12946 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXF1Q12946 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXF1Q12946 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXF1Q12946 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXF1Q12946 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXF1Q12946 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXF1Q12946 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXF1Q12946 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXF1Q12946 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXF1Q12946 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXF1Q12946 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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