Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX4Q12846 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX4Q12846 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX4Q12846 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX4Q12846 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX4Q12846 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX4Q12846 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX4Q12846 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX4Q12846 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX4Q12846 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX4Q12846 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX4Q12846 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX4Q12846 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX4Q12846 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
STX4Q12846 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
STX4Q12846 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX4Q12846 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX4Q12846 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX4Q12846 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX4Q12846 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX4Q12846 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX4Q12846 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX4Q12846 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX4Q12846 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX4Q12846 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX4Q12846 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
STX4Q12846 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX4Q12846 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX4Q12846 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STX4Q12846 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX4Q12846 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX4Q12846 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX4Q12846 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX4Q12846 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX4Q12846 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX4Q12846 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX4Q12846 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STX4Q12846 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STX4Q12846 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX4Q12846 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX4Q12846 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX4Q12846 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX4Q12846 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX4Q12846 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX4Q12846 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX4Q12846 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX4Q12846 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX4Q12846 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX4Q12846 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX4Q12846 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
STX4Q12846 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX4Q12846 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX4Q12846 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX4Q12846 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
STX4Q12846 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX4Q12846 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX4Q12846 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX4Q12846 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX4Q12846 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX4Q12846 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX4Q12846 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX4Q12846 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX4Q12846 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX4Q12846 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX4Q12846 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX4Q12846 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX4Q12846 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX4Q12846 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX4Q12846 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX4Q12846 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX4Q12846 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX4Q12846 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX4Q12846 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX4Q12846 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX4Q12846 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX4Q12846 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX4Q12846 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX4Q12846 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX4Q12846 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX4Q12846 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX4Q12846 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX4Q12846 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX4Q12846 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX4Q12846 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX4Q12846 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX4Q12846 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX4Q12846 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX4Q12846 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX4Q12846 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX4Q12846 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX4Q12846 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STX4Q12846 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX4Q12846 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX4Q12846 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX4Q12846 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX4Q12846 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX4Q12846 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX4Q12846 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX4Q12846 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX4Q12846 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
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