Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
STX4Q12846 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
STX4Q12846 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
STX4Q12846 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
STX4Q12846 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
STX4Q12846 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
STX4Q12846 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
STX4Q12846 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
STX4Q12846 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
STX4Q12846 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
STX4Q12846 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
STX4Q12846 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
STX4Q12846 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
STX4Q12846 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
STX4Q12846 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
STX4Q12846 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
STX4Q12846 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
STX4Q12846 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
STX4Q12846 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STX4Q12846 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STX4Q12846 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STX4Q12846 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STX4Q12846 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STX4Q12846 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STX4Q12846 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STX4Q12846 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STX4Q12846 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STX4Q12846 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STX4Q12846 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STX4Q12846 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STX4Q12846 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STX4Q12846 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STX4Q12846 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STX4Q12846 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STX4Q12846 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STX4Q12846 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STX4Q12846 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STX4Q12846 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX4Q12846 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STX4Q12846 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STX4Q12846 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STX4Q12846 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STX4Q12846 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STX4Q12846 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STX4Q12846 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STX4Q12846 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STX4Q12846 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STX4Q12846 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STX4Q12846 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX4Q12846 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX4Q12846 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
STX4Q12846 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STX4Q12846 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STX4Q12846 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STX4Q12846 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STX4Q12846 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STX4Q12846 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
STX4Q12846 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STX4Q12846 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX4Q12846 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX4Q12846 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX4Q12846 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STX4Q12846 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STX4Q12846 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STX4Q12846 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STX4Q12846 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STX4Q12846 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STX4Q12846 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
STX4Q12846 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
STX4Q12846 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STX4Q12846 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STX4Q12846 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STX4Q12846 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STX4Q12846 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STX4Q12846 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
STX4Q12846 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX4Q12846 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STX4Q12846 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STX4Q12846 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STX4Q12846 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STX4Q12846 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STX4Q12846 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STX4Q12846 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
STX4Q12846 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STX4Q12846 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STX4Q12846 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STX4Q12846 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STX4Q12846 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STX4Q12846 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STX4Q12846 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STX4Q12846 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STX4Q12846 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX4Q12846 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX4Q12846 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX4Q12846 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
STX4Q12846 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX4Q12846 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX4Q12846 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX4Q12846 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX4Q12846 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
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