Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPS29P62273 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPS29P62273 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS29P62273 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS29P62273 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS29P62273 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS29P62273 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS29P62273 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS29P62273 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS29P62273 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS29P62273 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS29P62273 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS29P62273 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS29P62273 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPS29P62273 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS29P62273 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS29P62273 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS29P62273 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS29P62273 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS29P62273 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS29P62273 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS29P62273 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS29P62273 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS29P62273 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS29P62273 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPS29P62273 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPS29P62273 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPS29P62273 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPS29P62273 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPS29P62273 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPS29P62273 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS29P62273 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS29P62273 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS29P62273 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS29P62273 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS29P62273 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS29P62273 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS29P62273 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS29P62273 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS29P62273 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS29P62273 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS29P62273 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS29P62273 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS29P62273 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS29P62273 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS29P62273 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS29P62273 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS29P62273 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS29P62273 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS29P62273 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS29P62273 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS29P62273 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS29P62273 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS29P62273 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS29P62273 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS29P62273 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS29P62273 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS29P62273 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS29P62273 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS29P62273 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS29P62273 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS29P62273 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS29P62273 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS29P62273 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS29P62273 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS29P62273 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS29P62273 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS29P62273 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS29P62273 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS29P62273 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS29P62273 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS29P62273 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS29P62273 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS29P62273 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS29P62273 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS29P62273 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS29P62273 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS29P62273 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS29P62273 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS29P62273 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS29P62273 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS29P62273 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS29P62273 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS29P62273 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS29P62273 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS29P62273 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS29P62273 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS29P62273 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS29P62273 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS29P62273 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS29P62273 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS29P62273 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS29P62273 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS29P62273 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS29P62273 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS29P62273 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS29P62273 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS29P62273 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS29P62273 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS29P62273 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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