Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUMO3P55854 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUMO3P55854 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUMO3P55854 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SUMO3P55854 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUMO3P55854 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUMO3P55854 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUMO3P55854 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms