Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPGP40121 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPGP40121 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPGP40121 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPGP40121 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPGP40121 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPGP40121 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPGP40121 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPGP40121 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPGP40121 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPGP40121 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPGP40121 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPGP40121 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPGP40121 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPGP40121 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPGP40121 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPGP40121 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPGP40121 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPGP40121 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPGP40121 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPGP40121 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPGP40121 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPGP40121 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPGP40121 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPGP40121 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPGP40121 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPGP40121 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPGP40121 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPGP40121 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPGP40121 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPGP40121 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPGP40121 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPGP40121 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPGP40121 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPGP40121 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPGP40121 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPGP40121 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPGP40121 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPGP40121 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPGP40121 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPGP40121 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPGP40121 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPGP40121 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPGP40121 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPGP40121 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPGP40121 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPGP40121 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPGP40121 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPGP40121 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPGP40121 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPGP40121 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPGP40121 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPGP40121 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPGP40121 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPGP40121 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPGP40121 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPGP40121 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPGP40121 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPGP40121 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPGP40121 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPGP40121 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPGP40121 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPGP40121 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPGP40121 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPGP40121 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPGP40121 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPGP40121 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPGP40121 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPGP40121 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPGP40121 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPGP40121 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPGP40121 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPGP40121 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPGP40121 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPGP40121 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPGP40121 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPGP40121 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPGP40121 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPGP40121 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPGP40121 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPGP40121 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPGP40121 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPGP40121 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPGP40121 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPGP40121 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPGP40121 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPGP40121 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPGP40121 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPGP40121 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPGP40121 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPGP40121 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPGP40121 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPGP40121 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPGP40121 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPGP40121 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPGP40121 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPGP40121 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPGP40121 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPGP40121 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPGP40121 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms