Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CAPGP40121 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CAPGP40121 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAPGP40121 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAPGP40121 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAPGP40121 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CAPGP40121 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CAPGP40121 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAPGP40121 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CAPGP40121 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAPGP40121 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAPGP40121 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAPGP40121 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAPGP40121 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CAPGP40121 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAPGP40121 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAPGP40121 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAPGP40121 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAPGP40121 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPGP40121 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAPGP40121 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAPGP40121 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPGP40121 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPGP40121 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPGP40121 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPGP40121 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPGP40121 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPGP40121 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPGP40121 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPGP40121 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPGP40121 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPGP40121 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPGP40121 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAPGP40121 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPGP40121 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPGP40121 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPGP40121 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPGP40121 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPGP40121 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPGP40121 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPGP40121 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPGP40121 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPGP40121 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPGP40121 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPGP40121 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPGP40121 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPGP40121 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPGP40121 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPGP40121 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPGP40121 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPGP40121 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPGP40121 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPGP40121 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPGP40121 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPGP40121 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPGP40121 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPGP40121 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPGP40121 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPGP40121 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPGP40121 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPGP40121 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPGP40121 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPGP40121 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPGP40121 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPGP40121 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPGP40121 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPGP40121 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPGP40121 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPGP40121 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPGP40121 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPGP40121 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPGP40121 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPGP40121 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPGP40121 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPGP40121 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPGP40121 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPGP40121 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPGP40121 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPGP40121 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPGP40121 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPGP40121 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPGP40121 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPGP40121 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPGP40121 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPGP40121 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAPGP40121 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPGP40121 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPGP40121 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPGP40121 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPGP40121 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPGP40121 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPGP40121 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPGP40121 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPGP40121 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPGP40121 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CAPGP40121 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPGP40121 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPGP40121 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPGP40121 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPGP40121 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms