Protein–RNA interactions for Protein: O95139

NDUFB6, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB6O95139 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFB6O95139 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFB6O95139 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFB6O95139 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFB6O95139 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFB6O95139 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFB6O95139 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFB6O95139 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFB6O95139 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFB6O95139 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFB6O95139 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFB6O95139 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFB6O95139 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFB6O95139 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB6O95139 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB6O95139 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFB6O95139 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFB6O95139 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB6O95139 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB6O95139 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB6O95139 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB6O95139 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB6O95139 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB6O95139 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB6O95139 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB6O95139 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB6O95139 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB6O95139 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB6O95139 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB6O95139 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB6O95139 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB6O95139 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB6O95139 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NDUFB6O95139 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB6O95139 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB6O95139 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB6O95139 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB6O95139 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB6O95139 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB6O95139 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB6O95139 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms