Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN2O60636 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN2O60636 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN2O60636 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN2O60636 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN2O60636 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN2O60636 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN2O60636 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN2O60636 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSPAN2O60636 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN2O60636 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN2O60636 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN2O60636 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSPAN2O60636 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN2O60636 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN2O60636 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN2O60636 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN2O60636 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN2O60636 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN2O60636 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN2O60636 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN2O60636 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN2O60636 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms