Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms