Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 DUS1L-213ENST00000580731 725 ntTSL 516.64■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 DUS1L-209ENST00000578428 688 ntTSL 215.82■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 CANX-216ENST00000510810 511 ntTSL 415.19■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 DUS1L-205ENST00000577574 473 ntTSL 514.69□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.064e-8■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 KDM5B-201ENST00000235790 4418 ntTSL 214.48□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 DUS1L-210ENST00000578846 4456 ntTSL 214.48□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 DUS1L-212ENST00000579854 657 ntTSL 214.2□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.34e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 SRRM1-223ENST00000600523 575 ntTSL 513.17□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 XPO1-214ENST00000461407 2676 ntTSL 212.95□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 CLINT1-210ENST00000530742 3344 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.384e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 ARID4B-205ENST00000421364 5151 ntTSL 1 (best)12.63□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 GDI2-206ENST00000456041 918 ntTSL 512.27□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.454e-8■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 SEC24A-201ENST00000322887 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.494e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 RPL17-220ENST00000615479 586 ntTSL 512□□□□□ -0.495e-10■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 RHOBTB3-214ENST00000513091 591 ntTSL 311.97□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 CUL1-203ENST00000602748 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 ARID4B-212ENST00000491632 3823 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 GDI2-202ENST00000380181 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 NUDCD1-203ENST00000519607 2286 ntTSL 1 (best)11.44□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 TOMM20-201ENST00000366607 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.583e-10■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 CANX-205ENST00000502673 1000 ntTSL 511.39□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 ADGRV1-223ENST00000639884 1177 ntTSL 511.38□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-231ENST00000557336 580 ntTSL 311.07□□□□□ -0.644e-42■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 IST1-222ENST00000545388 630 ntTSL 211.06□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 TIMELESS-203ENST00000553532 5121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-214ENST00000554969 1924 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.664e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.667e-7■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 DMXL2-201ENST00000251076 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-232ENST00000557442 1308 ntTSL 210.7□□□□□ -0.74e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-213ENST00000554891 644 ntTSL 510.61□□□□□ -0.714e-23■■■■■ 28.1
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RBM22Q9NW64 HNRNPC-230ENST00000557201 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.724e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-225ENST00000556513 1403 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.754e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 IST1-214ENST00000538709 491 ntTSL 210.31□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-208ENST00000553753 1790 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.774e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 TIMELESS-201ENST00000229201 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 TIMELESS-205ENST00000557589 2784 ntTSL 210.18□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 RPL21-202ENST00000311549 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 AFDN-221ENST00000511637 5999 ntTSL 1 (best)10.15□□□□□ -0.781e-11■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 CUL1-202ENST00000409469 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 28.1
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RBM22Q9NW64 RPL21-201ENST00000272274 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-219ENST00000555309 1714 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.84e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-218ENST00000555215 781 ntTSL 510□□□□□ -0.814e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-209ENST00000554383 1039 ntTSL 510□□□□□ -0.814e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 EIF3D-203ENST00000405442 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 SNRNP40-201ENST00000263694 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 MAN1A2-201ENST00000356554 8576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.833e-8■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 AFDN-204ENST00000366809 4839 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 XPO1-222ENST00000492182 827 ntTSL 29.82□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 RPL21-204ENST00000326092 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-224ENST00000556226 629 ntTSL 59.78□□□□□ -0.844e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-228ENST00000557033 760 ntTSL 39.78□□□□□ -0.844e-42■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 EIF3D-202ENST00000402116 581 ntTSL 39.73□□□□□ -0.851e-8■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-223ENST00000556142 1599 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.864e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 NUDCD1-201ENST00000239690 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 ZNF207-210ENST00000579634 580 ntTSL 39.58□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-216ENST00000555137 789 ntTSL 39.52□□□□□ -0.894e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 SEC24A-202ENST00000398844 6299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 SRRM1-221ENST00000593639 563 ntTSL 58.98□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 TTC3-216ENST00000479930 8998 ntTSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 UBAP2L-208ENST00000433615 1789 ntTSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 PTK2-203ENST00000430260 1940 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.983e-7■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-207ENST00000553614 604 ntTSL 58.88□□□□□ -0.994e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-222ENST00000555914 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -14e-23■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 SRRM1-205ENST00000462710 2624 ntTSL 58.79□□□□□ -11e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 SRRM1-217ENST00000490543 673 ntTSL 58.77□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.017e-7■■■■■ 28.1
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