Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.022e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CARM1-209ENST00000590699 2240 ntTSL 527.56■■■□□ 22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMK4-207ENST00000509408 599 ntTSL 427.47■■□□□ 1.992e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LSM14B-202ENST00000279069 811 ntTSL 327.17■■□□□ 1.942e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.912e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMK4-212ENST00000514007 852 ntTSL 526.71■■□□□ 1.872e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.862e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.842e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.842e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.832e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CCM2-211ENST00000478582 937 ntTSL 326.42■■□□□ 1.822e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.812e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.792e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMK4-204ENST00000504544 571 ntTSL 426.14■■□□□ 1.782e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMTA1-213ENST00000490738 538 ntTSL 226.1■■□□□ 1.772e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.752e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MXD3-205ENST00000503473 2279 ntTSL 525.93■■□□□ 1.742e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TAOK3-216ENST00000542532 641 ntTSL 225.92■■□□□ 1.742e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KLF13-206ENST00000558921 440 ntTSL 325.91■■□□□ 1.742e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.732e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMK4-206ENST00000508074 557 ntTSL 425.79■■□□□ 1.722e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KMT5B-211ENST00000458496 556 ntTSL 425.72■■□□□ 1.712e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LSM14B-205ENST00000400318 1073 ntTSL 1 (best)25.56■■□□□ 1.682e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.682e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TCEA2-201ENST00000339217 953 ntTSL 325.55■■□□□ 1.682e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PDCD4-205ENST00000467574 735 ntTSL 325.5■■□□□ 1.672e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NIT2-207ENST00000497785 795 ntTSL 525.47■■□□□ 1.672e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TRAF7-206ENST00000569686 586 ntTSL 225.45■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PDCD4-208ENST00000483670 774 ntTSL 525.44■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.652e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KIAA1211-207ENST00000629263 830 ntAPPRIS ALT2 TSL 525.25■■□□□ 1.632e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.612e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.612e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMK4-213ENST00000515231 1678 ntTSL 1 (best)24.8■■□□□ 1.562e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DCUN1D5-210ENST00000531571 1535 ntTSL 524.76■■□□□ 1.552e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.552e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.552e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CYLD-208ENST00000564634 539 ntTSL 324.64■■□□□ 1.542e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KMT5B-210ENST00000453170 594 ntTSL 524.62■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PHYKPL-211ENST00000494126 2297 ntTSL 1 (best)24.59■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.522e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.512e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ALKAL2-202ENST00000401489 526 ntTSL 324.03■■□□□ 1.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.422e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.422e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.42e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ENTPD6-210ENST00000433417 940 ntTSL 223.8■■□□□ 1.42e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ENTPD6-205ENST00000417467 809 ntTSL 523.8■■□□□ 1.42e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FZR1-206ENST00000588327 675 ntTSL 323.68■■□□□ 1.385e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RABGAP1-206ENST00000459903 572 ntTSL 423.58■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MXI1-207ENST00000453116 803 ntTSL 523.58■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.352e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.352e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB40C-212ENST00000569575 692 ntTSL 223.36■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NFRKB-204ENST00000526884 568 ntTSL 323.34■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPP1CB-208ENST00000455580 721 ntTSL 323.34■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TAOK3-217ENST00000542692 588 ntTSL 323.25■■□□□ 1.312e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.312e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TCEA2-216ENST00000487164 1060 ntTSL 1 (best)23.22■■□□□ 1.312e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.312e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.32e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MPP6-206ENST00000432190 982 ntTSL 323.08■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.282e-8■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PARD3B-205ENST00000415947 1668 ntTSL 1 (best)22.92■■□□□ 1.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB40C-209ENST00000565511 783 ntTSL 322.9■■□□□ 1.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ACYP2-205ENST00000458030 1330 ntTSL 322.88■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CSNK1G3-204ENST00000508708 920 ntTSL 222.85■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAPH1-206ENST00000420371 492 ntTSL 322.75■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC4A7-204ENST00000428005 1572 ntTSL 1 (best)22.75■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-218ENST00000522148 616 ntTSL 522.72■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MXI1-208ENST00000460667 782 ntTSL 322.68■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ENTPD6-212ENST00000439162 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.66■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NFRKB-211ENST00000532225 938 ntTSL 522.65■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAPH1-212ENST00000465669 360 ntTSL 222.65■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NFRKB-206ENST00000529319 843 ntTSL 322.65■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PHYKPL-204ENST00000474052 1539 ntTSL 1 (best)22.52■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 54.9
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 263.9 ms