RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467574.5

PDCD4-205, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 735 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-205ENST00000467574 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.32■■■■■ 7.73
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PDCD4-205ENST00000467574 ABCC9O60706 1549 aa54.89■■■■■ 6.38
PDCD4-205ENST00000467574 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.88■■■■■ 6.06
PDCD4-205ENST00000467574 NACADO15069 1562 aa52.85■■■■■ 6.05
PDCD4-205ENST00000467574 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.82■■■■■ 6.05
PDCD4-205ENST00000467574 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.61■■■■■ 6.01
PDCD4-205ENST00000467574 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.59■■■■■ 6.01
PDCD4-205ENST00000467574 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.43■■■■■ 5.98
PDCD4-205ENST00000467574 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.86■■■■■ 5.89
PDCD4-205ENST00000467574 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.38■■■■■ 5.82
PDCD4-205ENST00000467574 SCRIBQ14160 1630 aa51.35■■■■■ 5.81
PDCD4-205ENST00000467574 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.23■■■■■ 5.79
PDCD4-205ENST00000467574 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.78■■■■■ 5.72
PDCD4-205ENST00000467574 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.28■■■■■ 5.64
PDCD4-205ENST00000467574 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.96■■■■■ 5.59
PDCD4-205ENST00000467574 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.73■■■■■ 5.55
PDCD4-205ENST00000467574 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.32■■■■■ 5.49
PDCD4-205ENST00000467574 SMARCA4P51532 1647 aa49.16■■■■■ 5.46
PDCD4-205ENST00000467574 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.06■■■■■ 5.44
PDCD4-205ENST00000467574 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.82■■■■■ 5.41
PDCD4-205ENST00000467574 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.8■■■■■ 5.4
PDCD4-205ENST00000467574 SMARCA2P51531 1590 aa48.75■■■■■ 5.39
PDCD4-205ENST00000467574 NCAPD3P42695 1498 aa48.74■■■■■ 5.39
PDCD4-205ENST00000467574 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.7■■■■■ 5.39
PDCD4-205ENST00000467574 HMGXB3Q12766 1538 aa48.58■■■■■ 5.37
PDCD4-205ENST00000467574 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.38■■■■■ 5.34
PDCD4-205ENST00000467574 WIZO95785 1651 aa48.32■■■■■ 5.33
PDCD4-205ENST00000467574 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.26■■■■■ 5.32
PDCD4-205ENST00000467574 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.8■■■■■ 5.24
PDCD4-205ENST00000467574 NESP48681 1621 aa47.58■■■■■ 5.21
PDCD4-205ENST00000467574 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.47■■■■■ 5.19
PDCD4-205ENST00000467574 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.29■■■■■ 5.16
PDCD4-205ENST00000467574 ERCC6Q03468 1493 aa47.25■■■■■ 5.15
PDCD4-205ENST00000467574 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.19■■■■■ 5.14
PDCD4-205ENST00000467574 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.1■■■■■ 5.13
PDCD4-205ENST00000467574 CFTRP13569 1480 aa47.09■■■■■ 5.13
PDCD4-205ENST00000467574 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.05■■■■■ 5.12
PDCD4-205ENST00000467574 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.94■■■■■ 5.1
PDCD4-205ENST00000467574 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.92■■■■■ 5.1
PDCD4-205ENST00000467574 PRDM2Q13029 1718 aa46.89■■■■■ 5.1
PDCD4-205ENST00000467574 CUX2O14529 1486 aa46.78■■■■■ 5.08
PDCD4-205ENST00000467574 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.78■■■■■ 5.08
PDCD4-205ENST00000467574 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.71■■■■■ 5.07
PDCD4-205ENST00000467574 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.63■■■■■ 5.06
PDCD4-205ENST00000467574 WDR62O43379 1518 aa46.54■■■■■ 5.04
PDCD4-205ENST00000467574 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.37■■■■■ 5.01
PDCD4-205ENST00000467574 TOPBP1Q92547 1522 aa46.08■■■■■ 4.97
PDCD4-205ENST00000467574 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.05■■■■■ 4.96
PDCD4-205ENST00000467574 ABCC8Q09428 1581 aa46.01■■■■■ 4.96
PDCD4-205ENST00000467574 CUX1P39880 1505 aa45.81■■■■■ 4.92
PDCD4-205ENST00000467574 IFT140Q96RY7 1462 aa45.72■■■■■ 4.91
PDCD4-205ENST00000467574 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.7■■■■■ 4.91
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PDCD4-205ENST00000467574 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.59■■■■■ 4.89
PDCD4-205ENST00000467574 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.55■■■■■ 4.88
PDCD4-205ENST00000467574 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.47■■■■■ 4.87
PDCD4-205ENST00000467574 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.47■■■■■ 4.87
PDCD4-205ENST00000467574 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.46■■■■■ 4.87
PDCD4-205ENST00000467574 SYNJ1O43426 1573 aa45.45■■■■■ 4.87
PDCD4-205ENST00000467574 TOP2BQ02880 1626 aa45.44■■■■■ 4.86
PDCD4-205ENST00000467574 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.43■■■■■ 4.86
PDCD4-205ENST00000467574 SOGA1O94964 1423 aa45.42■■■■■ 4.86
PDCD4-205ENST00000467574 WDR97A6NE52 1622 aa45.35■■■■■ 4.85
PDCD4-205ENST00000467574 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.25■■■■■ 4.83
PDCD4-205ENST00000467574 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.16■■■■■ 4.82
PDCD4-205ENST00000467574 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.16■■■■■ 4.82
PDCD4-205ENST00000467574 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.13■■■■■ 4.82
PDCD4-205ENST00000467574 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.05■■■■■ 4.8
PDCD4-205ENST00000467574 PBRM1Q86U86 1689 aa44.96■■■■■ 4.79
PDCD4-205ENST00000467574 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.94■■■■■ 4.78
PDCD4-205ENST00000467574 GRIN2BQ13224 1484 aa44.91■■■■■ 4.78
PDCD4-205ENST00000467574 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.88■■■■■ 4.78
PDCD4-205ENST00000467574 CHD1O14646 1710 aa44.87■■■■■ 4.77
PDCD4-205ENST00000467574 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.82■■■■■ 4.77
PDCD4-205ENST00000467574 OSCARQ8IYS5 282 aa44.72■■■■■ 4.75
PDCD4-205ENST00000467574 SYNJ2O15056 1496 aa44.63■■■■■ 4.73
PDCD4-205ENST00000467574 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.62■■■■■ 4.73
PDCD4-205ENST00000467574 ADAMTS12P58397 1594 aa44.6■■■■■ 4.73
PDCD4-205ENST00000467574 FBLN2P98095 1184 aa44.54■■■■■ 4.72
PDCD4-205ENST00000467574 KIF27Q86VH2 1401 aa44.48■■■■■ 4.71
PDCD4-205ENST00000467574 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
PDCD4-205ENST00000467574 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.41■■■■■ 4.7
PDCD4-205ENST00000467574 GRIN2AQ12879 1464 aa44.38■■■■■ 4.69
PDCD4-205ENST00000467574 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.36■■■■■ 4.69
PDCD4-205ENST00000467574 TRIM41Q8WV44 630 aa44.32■■■■■ 4.69
PDCD4-205ENST00000467574 IGF1RP08069 1367 aa44.3■■■■■ 4.68
PDCD4-205ENST00000467574 CUL7Q14999 1698 aa44.27■■■■■ 4.68
PDCD4-205ENST00000467574 CEP170Q5SW79 1584 aa44.21■■■■■ 4.67
PDCD4-205ENST00000467574 NUP160Q12769 1436 aa44.2■■■■■ 4.67
PDCD4-205ENST00000467574 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.19■■■■■ 4.66
PDCD4-205ENST00000467574 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.19■■■■■ 4.66
PDCD4-205ENST00000467574 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.19■■■■■ 4.66
PDCD4-205ENST00000467574 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.18■■■■■ 4.66
PDCD4-205ENST00000467574 ARHGEF11O15085 1522 aa44.16■■■■■ 4.66
PDCD4-205ENST00000467574 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.01■■■■■ 4.64
PDCD4-205ENST00000467574 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.93■■■■■ 4.62
PDCD4-205ENST00000467574 SHROOM2Q13796 1616 aa43.91■■■■■ 4.62
PDCD4-205ENST00000467574 ARAP1Q96P48 1450 aa43.83■■■■■ 4.61
PDCD4-205ENST00000467574 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.79■■■■■ 4.6
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